Бактерии протеи: Proteus (протей бактерия): особенности, в чем опасность

Содержание

Бактерия Протей (Proteus) и протейная инфекция

Назад к списку

13.05.2012

В последние годы инфекционисты отмечают рост заболеваний, обусловленных нетрадиционными микроорганизмами. Особое место занимает протейная инфекция. Ее кишечная форма, вызванная бакетриями рода ПротейP. vulgaris протекает тяжелее у детей раннего возраста. Не менее опасны  гнойно-воспалительные заболевания мочевыводящей системы, вызываемые P. mirabilis, P. rettgeri и P. morganii.

 В греческой мифологии Протей – божество, способное менять облик. Отсюда название полиморфных, мелких, нитевидных палочек, отличающихся активной подвижностью.

Размеры клеток составляют 0,5 — 3 мкм. P. morganii, P. rettgeri — менее полиморфны и малоподвижны.

Протейная инфекция: причины, развитие, опасность для организма

Возбудителями протейной инфекции являются грамотрицательные условно-патогенные микроорганизмы семейства энтеробактерий, которые присутствуют в нормальной микрофлоре кишечника, а также повсеместно распространены в воздухе, почве и воде. Бактерии рода Proteus в течение долгого времени не причислялись к возбудителям серьезных инфекционно-воспалительных заболеваний. Однако в связи с последними достижениями в области диагностики было обнаружено, что эти микроорганизмы способны вызывать трудно поддающиеся лечению патологии (протеозы), поражающие преимущественно ЖКТ и мочеполовую систему.

Протей – факультативный анаэроб, палочковидная, неспороносная, подвижная, грамотрицательная бактерия. В микробиологическом анализе кала протей встречается в комплексе с другими условно-патогенными бактериями семейства энтеробактерий. Кроме протея, в составе нормальной микрофлоры кишечника человека определяются: клебсиелла, энтеробактер, гафния, серратия, морганелла, провиденция, цитробактер. В 1 г кала должно быть меньше 104 общего количества этих бактерий. Большее количество перечисленных бактерий является признаком дисбактериоза.

В природе бактерии рода Proteus обнаруживаются: в сточных водах, в земле, в водоемах, на овощах, в разлагающихся органических веществах. Эти микроорганизмы — сапрофиты, они живут на слизистых оболочках, на коже, в кишечнике человека и животных. Протеи устойчивы во внешней среде и сохраняют жизнедеятельность в слабых растворах фенола и других средств. Выявлена также резистентность ко многим антибиотикам.

Причины протейной инфекции

Протейная палочка, присутствующая в кишечной микрофлоре в небольших количествах, не причиняет организму никакого вреда. При определенных обстоятельствах (снижение иммунитета, неправильное питание, длительный прием антибиотиков) она может активизироваться и начать интенсивно размножаться.

Также инфицирующее количество этих бактерий способно проникнуть в организм из внешней среды.

Основными путями передачи инфекции являются пищевой и контактно-бытовой. Чаще всего заражение происходит при употреблении белковых продуктов (мяса, рыбы, молока, колбасы), которые хранились с нарушением надлежащих сроков и условий. Значительно реже инфицирование осуществляется через немытые руки, во время купания или при употреблении зараженной воды.

Инфицирование протеем может произойти через полуфабрикаты, сырые продукты или готовые блюда из мяса, рыбы, молока, колбасы, студня. В них происходит быстрое размножение бактерий с образованием токсинов. Реже отмечают водный путь передачи: при купании в загрязненных водоемах или употреблении инфицированной воды. Возможен и контактный путь передачи на инфицированных руках зараженного человека.

Развитие патологии

При непосредственном попадании протея в ЖКТ вместе с продуктами питания инфекционное заболевание развивается очень стремительно. Первые симптомы ярко выражены, а общая клиническая картина совпадает с проявлениями сильного пищевого отравления. При контактно-бытовом способе заражения развитие признаков инфекции обычно происходит медленнее.

Если инфекционный процесс протекает в легкой форме, больной испытывает слабость, у него отмечаются повышение температуры, рвота, боль в животе, частый водянистый стул, в котором могут обнаруживаться слизь и зеленые включения. При тяжелом течении заболевания приступы рвоты случаются около 10 раз за сутки и более, а температура обычно поднимается до 40°С.

При условии своевременного и адекватного лечения вся острая симптоматика протеоза легкой или средней степени тяжести исчезает спустя несколько дней, после чего больной быстро идет на поправку.

Протеи выделяют токсические вещества — эндотоксины с гемолитическими свойствами и с различной степенью биохимической активности. У штаммов P. vulgaris обнаружена лецитиназная  активность. Протеи обладают способностью адгезии к уротелию при помощи ресничек. Отмечают, что резистентность к антибиотикам связана с адгезивной способностью уропатогенных протеев.

Острой кишечной протейной инфекцией, протекающей по типу гастроэнтерита, гастрита и колиэнтерита часто болеют дети раннего возраста с пониженным иммунитетом и после бесконтрольного назначения антибиотиков

. Заболевание сопровождается симптомами токсикоза — повышением температуры, рвотой, метеоризмом, схваткообразными болями в животе, нарушением аппетита, кратковременными судорогами, появлением водянистого, зловонного, учащенного стула.

В тяжелых случаях могут развиться осложнения: гемолитико-уремический синдром,  а также симптомы острой гемолитической тромбопении, анемии или острой почечной недостаточности.

Клинические проявления внутрибольничной инфекции протейной этиологии

весьма разнообразны: поражения мочевыводящей системы, отиты, холециститы, нагноения ран и септические состояния. Попадание протеев в пупочную ранку новорожденного может привести к бактериемии или развитию менингита.

Данные заболевания могут развиться: при передаче возбудителя контактно-бытовым или  воздушно-капельным путями, при заносе с катетером,  другими урологическими  инструментами.
Ультратонкий срез клетки Proteus alcalifaciens. Увеличение *83000
Если в мазках исследуемого материала (участки ожоговой ткани, гной, раневое отделяемое, испражнения) обнаруживаются грамотрицательные палочки, то бактериоскопический метод позволяет сделать предварительное заключение. Бактериологическим методом на средах определяют колонии

протея в виде тонкого стелющегося налета. Активно размножаются протеи на белковой питательной среде вызывают гниение мяса, рыбы, других белковых продуктов.

Важнейшие профилактические меры — это соблюдение санитарного режима в детских учреждениях и стационарах, проведение общесанитарных мероприятий. Для профилактики протея каждому необходимо соблюдать правила личной гигиены, исключить потребление подозрительных продуктов в питании, избегать контактов с больными детьми и взрослыми.

При лечении протейной инфекции следует придерживаться лечебной щадящей диеты с исключением жареных, острых блюд, белковых продуктов. В острый период протейного инфицирования, при поражении желудочно-кишечного тракта  — необходимо обеспечить восполнение потерянной жидкости. Полезно употреблять отвары трав – тысячелистника, алтея, зверобоя, ромашки, календулы; морсы, компоты с клюквой, черной смородиной, абрикосами, черникой, яблоками. Применять антибиотики можно только по назначению врача, в соответствии с данными анализов чувствительности бактерии протея к ним. 

Обязательно нужно принимать препараты – пробиотики, пребиотики, синбиотики для восстановления нормальной флоры кишечника.

Синбиотические комплексы Нормофлорины, содержащий живые активные лакто- и бифидобактерии, секретирующие молочную, уксусную, масляную, пропионовую кислоты, оказывающие защитное, антисептическое, противовоспалительное, сорбционное  действие – уменьшает интоксикацию, улучшает моторику кишечника, функцию печени, повышает иммунную реактивность. Это помогает в борьбе с

протейной инфекцией, восстанавливает работу желудочно-кишечного тракта, общее самочувствие, повышает иммунитет.

Схема (возрастные дозировки для детей или взрослых): (взрослый) нормофлорин Л – 20 мл (при диарее) – 40 (при запорах) мл утром перед едой, Д — 40 мл вечером за 20 мин до еды, Б – 20-30 мл на ночь в клизме. При диарее в обед можно добавить Д – 30-40 мл, при запорах в обед + Л – 30-40 мл.

Курс приема нормофлоринов — 1 — 1,5 месяца, для выведения токсинов, патогенной микрофлоры, восстановления полезных собственных бактерий. Уникальный состав нормофлоринов, не содержащих белков коровьего молока, молочного сахара, консервантов позволяет при протейной  инфекции успешно применять его у детей с первых дней жизни, беременных, кормящих, больных сахарным диабетом, аллергическими заболеваниями, т.е. у взрослых при любой сопутствующей патологии.

Опасность протейной инфекции

Протейная инфекция

Тяжелые формы патологии могут осложняться состояниями, требующими срочной госпитализации больного, такими как сильное обезвоживание, судороги, инфекционно-токсический шок.
protey_mirabilis
Помимо острых инфекций пищеварительной системы бактерии Proteus способны поражать другие органы, распространяясь через кровь или по лимфатическим сосудам. Очаг воспаления может локализоваться в мочеполовой системе, глазах, ушах, легких и даже в костной ткани или мозговых оболочках. Данные патологии достаточно часто переходят в хроническую форму с упорным рецидивирующим течением, которая тяжело поддается терапии.

Если протейная инфекция заносится на незажившие поверхности кожи и слизистых оболочек (послеоперационные раны, ожоги), вызванный ею воспалительный процесс значительно замедляет регенерацию тканей и снижает эффективность лечебных мероприятий.

Следует отметить, что даже незначительное превышение нормального количества протейной палочки в кишечной микрофлоре может негативно отразиться на состоянии здоровья. Так, если у человека имеются аутоиммунные болезни, существует высокий риск их обострения из-за возросшей активности протейной палочки. Атопический дерматит, астма, аллергические заболевания и другие иммунозависимые патологии могут впервые развиться или обостриться под воздействием бактерий Proteus.

Назад к списку

Протейная инфекция — Удмуртский ветеринарно-диагностический центр

 

За прошедшие две недели сотрудниками бактериологического отдела было выявлено

4 случая протейной инфекции:

-1 случай в мясе вынужденного убоя от крупного рогатого скота;

-2 случая в материале от птицы;

-1 случай в корме растительного происхождения.

Инфекции, вызванные протеем, в настоящее время приобретают все большее распространение в силу совершенствования методов выявляемости.

Так кто же такой протей и чем он опасен.

Протейная инфекция — энтеробактериальная болезнь молодняка животных, в том числе птиц, характеризующаяся нарушением пищеварения.

Возбудитель. Болезнь вызывают кишечные бактерии из семейства Enterobacteriaceae. Род Proteus характеризуют полиморфность палочек грамнегативность, отсутствие образования спор и капсул, подвижность за счет перитрихиальных жгутиков.

Выделяют несколько видов протея: Proteus mirabilis, Proteus vulgaris, Proteus myxofaciens, Proteus hauseri, Proteus penneri.

В этиопатогенезе кишечных расстройств у молодняка участвуют в основном P. vulgaris и P. mirabilis. Эти виды протея — наиболее часто выделяемые и патогенные для животных, в том числе птиц. Из лабораторных животных к парентеральному введению протея чувствительны белые мыши, кролики, морские свинки. Являясь слабовирулентными, протейные палочки становятся причиной болезни ослабленного молодняка, наиболее подверженного стрессам, находящегося в иммунодепрессивном состоянии. Кроме того, протейные инфекции часто развиваются вторично при дисбактериозах неспецифического характера (диспепсия, гастроэнтериты) и при вирусной инфекции. Пассажируясь через ослабленных животных, возбудитель накапливает вирулентность и выделяется в больших количествах с фекальными массами больных животных. Это служит причиной заражения молодняка остального поголовья, что приводит, несомненно, к нежелательным финансовым растратам. Палочки протея выделяют из ран, среднего уха при отитах, смывов с глазного яблока при керато-конъюнктивальных поражениях, дерматитных и язвенных поражений межпальцевых пространств, ногтевого ложа, носового хода животных практически всех видов, в том числе птиц, а также человека..

Восприимчивые животные. Преимущественно телята первых трех недель жизни, поросята до 2-месячного возраста.. Протей может быть причиной пищевых токсикоинфекций человека.

Основой постановки диагноза являются бактериологические исследования с обязательной постановкой биопробы.

 

Дифференциальный диагноз. Протейную инфекцию дифференцируют от сходно протекающих заболеваний молодняка: эшерихиоза, сальмонеллеза, клебсиеллеза, псевдомоноза, стрептококкоза, диспепсии, рота-, корона-, парво-, аденовирусных инфекций, вирусной диареи, дизентерии свиней. Дифференциальная лабораторная диагностика протейной инфекции не вызывает затруднений — протей легко отличим по культуральным свойствам.

Центральная научно-методическая ветеринарная лаборатория

Специалисты:

В отделе работает 6 специалистов (заведующий отделом, заместитель заведующего отделом, 2 ветеринарных врача, ветеринарный фельдшер и лаборант). Все специалисты имеют большой опыт работы, регулярно повышают свой профессиональный уровень. Компетенция специалистов отдела ежегодно подтверждается при проведении межлабораторных сравнительных испытаний.

Функции отдела:

Проведение ветсанэкспертизы пищевых продуктов, сырья растительного и животного происхождения:
— Ветеринарно-санитарная экспертиза туш и органов при вынужденном убое, определение степени свежести сырья и пищевых продуктов.
— Послеубойная трихинеллоскопия туш свиней и мяса используемых в пищу диких животных (дикий кабан, медведь, барсук и т. д.).
— Определение ингибирующих веществ и количества соматических клеток в молоке.
— Исследования меда по физико-химическим показателям: определение массовой доли воды, редуцирующих сахаров, диастазного числа, фальсификаций, механических примесей, общей кислотности.

Исследование пищевых продуктов и сырья по показателям микробиологической безопасности:
— Санитарно-показательные – количество мезофильных аэробных и факультативно-анаэробных микроорганизмов (КМАФАнМ), бактерии группы кишечной палочки БГКП (колиформы), бактерии семейства энтеробактерий.
— Условно-патогенные микроорганизмы – кишечная палочка, золотистый стафилококк, бактерии рода протея, Бац. цереус, сульфитредуцирующие клостридии, парагемолитический вибрион.
— Патогенные микроорганизмы, в т.ч. сальмонеллы и Листерия моноцитогенес.
— Микроорганизмы порчи – дрожжи, плесневые грибы, молочнокислые микроорганизмы.
— Микроорганизмы заквасочной микрофлоры ( молочнокислые бактерии) в продуктах с нормируемым уровнем биотехнологической микрофлоры и в пробиотических продуктах.
— Контроль промышленной стерильности консервов.

Микробиологический анализ кормов растительного и животного происхождения:
— Определение общей бактериальной обсемененности.
— Патогенных бактерий группы кишечной палочки, протея.
— Сальмонелл.
— Патогенных анаэробов, ботулинического токсина.

Санитарно-бактериологическое исследование смывов с поверхностей технологического оборудования производственных цехов мясокомбинатов, мясоперерабатывающих пунктов, цехов по производству пищевых продуктов, птицефабрик, инкубационно-птицеводческих станций, молочно-товарных ферм, колхозных рынков на следующие показатели:
— Общее количество микробных клеток.
— Коли-титр (количество кишечной палочки).
— Наличие патогенных бактерий (сальмонелл, энтеропатогенных серовариантов кишечной палочки, протея, L.monocytogenes, анаэробов).
— Наличие S. aureus.
— Контроль качества дезинфекции по наличию бактерий группы кишечной палочки , стафилококков.

Отдел оснащен необходимым современным оборудованием, реактивами, питательными средами.

Сдать анализ кала на дисбактериоз кишечника

Метод определения Бактериологический, бактериоскопический

Исследуемый материал Кал

Доступен выезд на дом

Синонимы: Дисбиоз кишечника; Анализ кала на дисбактериоз. 

Intestinal dysbiosis; Intestinal disbios; Intestinal dysbacteriosis. 

Краткое описание исследования «Дисбактериоз кишечника»  

В медицинских офисах Москвы и Московской области приём биоматериала для выполнения теста № 456 производится 7 дней в неделю с ограничениями по времени взятия. Интересующую информацию уточняйте у администраторов медицинских офисов. 

Дисбактериоз (в англоязычной литературе используют термин Intestinal bacterial overgrowth, реже – disbios) острое или хроническое нарушение нормальной микрофлоры кишечника. 

В содержимом тощей кишки здоровых людей может находиться до 105 бактерий в 1 мл кишечного содержимого. Основными являются молочнокислые палочки, стафилококки и стрептококки, другие грамположительные аэробные бактерии и грибы. В дистальном отделе подвздошной кишки количество микробов увеличивается до 108, в первую очередь за счёт энтерококков, кишечной палочки, бактероидов и анаэробных бактерий. В толстой кишке преобладают анаэробы (бактероиды, клостридии, лактобациллы). Этот симбиоз бактерий у здорового человека (и у млекопитающих!) выполняет многие полезные функции: противодействует чужеродным патогенным микробам и вирусам, помогает пищеварению, синтезирует витамины группы В. 

Соотношение количества различных микроорганизмов достаточно постоянно. Но вследствии ослабления иммунитета, нерациональной терапии антибиотиками, лучевой и химиотерапии, врождённых дефектов ферментов баланс нарушается. Могут исчезнуть некоторые представители нормальной микрофлоры (бифидобактерии, молочнокислые и кишечные палочки) и появиться грибки рода кандида, стафилококки, протей, синегнойная палочка. Возникает клинический синдром, для которого характерны понос, стеаторея, снижение веса и анемия. При резком ослаблении защитных сил, иммунитета может развиться генерализованная форма эндогенной инфекции вплоть до сепсиса. 

С какой целью проводят исследование на дисбактериоз кишечника

Исследование микрофлоры кишечника применяют для определения характера нарушения биоценоза кишечника.  

Выявляемые микроорганизмы и возбудители в исследовании «Дисбактериоз кишечника» 

 Выделяемые микроорганизмы и возбудители:  

  • полезные бактерии кишечника – лактобактерии, бифидобактерии, кишечные палочки с типичными свойствами, а также со сниженными ферментативными и гемолитическими признаками; 
  • условно-патогенные бактерии – энтеробактерии, неферментирующие бактерии, стафилококки, энтерококки, анаэробные бактерии (клостридии, без идентификации до вида), грибы; 
  •  патогенные – сальмонеллы, шигеллы.

По живущим во рту бактериям можно определить человека

Состав живущих в ротовой полости бактерий оказался уникальным для каждого человека. В большой степени на него влияет этническая принадлежность.

По составу бактерий, живущих глубоко во рту человека за пределами десен, можно определить его этническую принадлежность. Об этом заявляют американские пародонтологи из Университета штата Огайо в своей статье, опубликованной в последнем номере журнала PLOS ONE.

В ходе исследования ученые обследовали ротовую полость 100 человек, среди которых были белые американцы, темнокожие, китайцы и латиноамериканцы. Они выяснили, что в состав колоний, живущих за деснами, входит почти 400 различных видов бактерий,

однако люди по этому составу сильно различаются.

Только 2% обнаруженных видов присутствовали во всех колониях, да и то в разных количествах. У 90% участников исследования только 8% видов бактерий оказались общими.

При этом оказалось, что для каждой этнической группы характерен свой состав популяций.

«Мы впервые показали, что этническая принадлежность влияет на то, что вы носите у себя во рту, — говорит адьюнкт-профессор пародонтологии Пурнима Кумар, возглавляющая это исследование. — Мы знаем, что наша диета и особенности гигиены рта диктуют, каким бактериям выживать и каким процветать, вот почему дантисты так настаивают на частом применении зубных нитей и щеток. Но вот вопрос — может ли наша генетика играть ту же роль? И, похоже, ответ в данном случае положительный — да, может».

По словам Кумар, набор бактерий во рту у разных людей всегда индивидуален.

«Нет двух людей, одинаковых в этом смысле, — говорит она. — Это самые настоящие «отпечатки пальцев».

Кумар и ее группа определяли вид каждой бактерии, секвенируя их ДНК. Всего они обнаружили 398 видов бактерий, 60% из них никогда прежде не были классифицированы. В среднем у каждого человека во рту они обнаруживали по 150 видов бактерий. Определив ассортимент, типичный для каждой этнической группы,

они смогли в дальнейшем предсказывать по бактериальному составу ротовой полости этническую принадлежность их хозяина с вероятностью 62%.

При этом этническую принадлежность афроамериканцев они определяли со стопроцентной вероятностью, латиноамериканцев они смогли узнать с вероятностью 67%, а людей европейского типа — с 50-процентной вероятностью. Иными словами, у европейского типа индивидуальные различия набора бактерий перекрывали их общие черты.

Бактерии, живущие за границей десен, наиболее защищены от окружающей среды, на них меньше всего влияют особенности диеты, гигиенические привычки, курение и прочие внешние воздействия. Однако и до границ десен, там, где эти воздействия сильны, у 80% участников исследователи обнаружили колонии бактерий, так называемые биопленки, по которым этническая принадлежность также прочитывалась, хотя и с меньшей вероятностью. Следовательно, и здесь генетика играла роль в бактериальном составе колоний.

«Самый главный вывод из нашей работы, — говорит Кумар, — заключается в том, что

этнически специфические сообщества бактерий во рту человека определяют его предрасположенность к будущим заболеваниям ротовой полости».

Исследование действительно объяснило, почему люди разных этнических групп по-разному восприимчивы к стоматологическим заболеваниям. Более того, оно подтвердило давно высказываемое предположение, что и лечить их в зубоврачебном кресле надо по-разному, и применять к санации полости рта более индивидуальный подход. Хотя сегодня менять что-то в зубоврачебной практике на основе этих открытий, по словам Кумар, слишком рано. Но они представляют собой огромный потенциал для разработки будущих индивидуальных подходов к лечению заболеваний. Список их широк — от кариеса и пародонтоза до рака ротовой полости.

Южный федеральный университет | Пресс-центр: Микробиологи КФУ работают над преодолением устойчивости бактерий к антибиотикам


Сотрудники кафедры микробиологии КФУ проводят исследования, направленные на выявление факторов, которые позволяют бактериям выживать в организме человека даже под воздействием сильнейших антибиотиков. Результаты помогут преодолеть устойчивость патогенов к лекарственным препаратам.

Внимание ученых сосредоточено на изучении свойств бактерий рода Proteus,MorganellaProvidencia и Serratia, которые относятся к условно-патогенным микроорганизмам, но именно в этой «условности» и заключается их основная опасность – такие бактерии зачастую становятся причиной распространения внутрибольничных инфекций.

«Перечень так называемых факторов вирулентности, которые помогают микроорганизмам выживать в организме человека, противостоять защитным механизмам, а также вырабатывать устойчивость по отношению к антибактериальным препаратам, очень широк, – поясняет участник проекта, доцент кафедры микробиологии КФУ Айслу Марданова. – На сегодняшний день мы занимаемся определением роли, которую играют в этих процессах гидролитические ферменты, ускоряющие расщепление жиров, белков и углеводов. Кроме того, мы заняты изучением факторов, которые влияют на способность бактерий к инвазии – проникновению в клетки организма человека – и образованию биопленок, защищающих патогенные микроорганизмы от внешнего воздействия и в значительной мере снижающих эффективность антибиотикотерапии».

Примечательно, что ранее многие условно-патогенные энтеробактерии, в частности, такие как морганеллы и серрации, не считались опасными. Эти бактерии относились к привычным для кишечника человека микроорганизмам. Однако в настоящее время стало очевидным, что помимо таких широко распространенных заболеваний, как цистит, пиелонефрит и дисбактериоз, морганеллы могут быть причиной гораздо более серьезных проблем со здоровьем – эти микроорганизмы могут вызвать менингит, хронический сепсис и эндокардит.

Что касается  серраций, они способны поражать даже костные ткани, и, кроме того, вызывать заболевания глаз и пневмонию. Не менее опасными являются бактерии родовProteus  и Providencia, которые зачастую становятся причиной острых кишечных инфекций, заболеваний мочевыводящих путей и почек. Наибольшую опасность эти бактерии представляют для больных, в лечении которых используются катетеры.

На данный момент ученым удалось выявить взаимосвязь между способностью к инвазии разных видов энтеробактерий и их способностью к синтезу внеклеточных и внутриклеточных ферментов определенного типа – металлопротеиназ. Кроме того, результаты исследований показали, что наличие способности к синтезу этих ферментов у протей повышает степень токсического воздействия патогенных бактерий на клетки тканей человека.

Также учеными КФУ был секвенирован полный геном Serratia grimesiiанализ которого позволил выявить гены, участвующие в формировании устойчивости к различным антибиотикам, в частности к бета-лактамным  препаратам. А в клетках бактерий родаMorganella был обнаружен новый фермент, отвечающий за аналогичные процессы.

Добавим, по результатам исследований были опубликованы статьи в журналах «Genome Announcement», «Microbiology», «Известия Российской академии наук», «Биоорганическая химия»

 

Протей — sofiapet — LiveJournal

Протей (лат. proteus) — род грамотрицательных, споронеобразующих, факультативно анаэробных бактерий. Представитель нормальной, условно-патогенной микрофлоры кишечника человека.
Протей в систематике бактерий Род протей (proteus) входит в семейство энтеробактерии (enterobacteriaceae), порядок энтеробактерии (enterobacteriales), класс гамма-протеобактерии (γ proteobacteria), тип протеобактерии (proteobacteria), царство бактерии.

Род протей включает следующие виды: proteus hauseri, proteus mirabilis, proteus myxofaciens, proteus penneri, proteus vulgaris.

Ранее относящиеся к роду протей бактерии вида proteus morganii перенесены в род morganella morganii семейства энтеробактерий, а proteus rettgeri реклассифицированы в providencia stuartii и providencia rettgeri.
Протеи имеют вид мелких, 0,3 на 3 мкм, нитевидных палочек. Они отличаются очень активной подвижностью. Протеи обладают токсическими (вырабатывают эндотоксин) и гемолитическими свойствами.
Протеи считаются санитарно-показательными бактериями. Количество обнаруживаемых proteus mirabilis рассматривают как показатель фекального загрязнения, а proteus vulgaris —  как показатель загрязнения объекта органическими веществами.

Протей — причина заболеваний человекаТри вида из рода протей — proteus mirabilis, proteus vulgaris и proteus penneri являются патогенными для человека, причем 75–90 % инфекций вызывает proteus mirabilis.
Наиболее часто острые кишечные инфекции, вызываемые протеем, встречаются у детей раннего возраста: ослабленных или с пониженным иммунитетом. Причиной протейной инфекции также может быть бесконтрольный прием антибиотиков. Заболевание обычно протекает в виде гастроэнтерита, гастрита и колиэнтерита. Очень часто острые кишечные протейные инфекции сопровождается повышением температуры, рвотой, нарушением аппетита, кратковременными судорогами, наблюдается также изменение характера стула и его учащение.
Бактерии рода протей, наряду с другими микроорганизмами, могут вызывать заболевания мочевыводящих путей и почек человека, в частности, острый и хронический простатит, цистит, пиелонефрит, в том числе большинство ксантогранулематозных пиелонефритов. Proteus mirabilis является причиной раневых инфекций. Proteus vulgaris присутствует в кишечнике здорового человека и многих животных, он обнаруживается в навозе, почве и загрязненных водах.
Протей в результатах анализа кала на дисбактериоз

При микробиологическом анализе кала протей рассматривается в комплексе с другими условно-патогенными бактериями, относящимися к семейству энтеробактерий и входящими в состав нормальной микрофлоры кишечника человека (кроме протея это клебсиелла, энтеробактер, гафния, серратия, морганелла, провиденция, цитробактер и др. ). В норме общее количество этих бактерий (колониеобразующих единиц, КОЕ) в 1 г кала должно быть меньше 104. Большее количество перечисленных бактерий является признаком дисбактериоза.

Протей обнаруживается в кале у 2,0±0,5 % здоровых людей, причем среднее содержание в 1 г кала от 1600 до 4000 КОЕ протея (М.Д.Ардатская, О.Н.Минушкин).

Терапия при избыточном росте протеяПриказом Минздрава РФ № 231 от 9 июня 2003 г. Об утверждении отраслевого стандарта «Протокол ведения больных. Дисбактериоз кишечника» при избыточном росте протея (proteus mirabilis, proteus vulgaris) детям рекомендованы бактериофаги «Интести-бактериофаг жидкий», «Бактериофаг протейный жидкий», «Бактериофаг колипротейный жидкий», «Колипротеофаг в таблетках», «Пиобактериофаг комбинированный жидкий», «Пиополифаг в таблетках», «Пиобактериофаг поливалентный очищенный жидкий».

Интести-бактериофаг жидкий принимают внутрь 4 раза в сутки натощак, за 1–1,5 часа до приема пищи. Детям первых месяцев жизни препарат в первые два дня приема разводят кипяченой водой в два раза, в случае отсутствия побочных реакций (срыгивания, высыпаний на коже) в дальнейшем можно применять бактериофаг не разведенным. Перед приемом бактериофага детям старше 3 лет следует принимать раствор питьевой соды 1/2 чайной ложки на 1/2 стакана воды или щелочную минеральную воду. Разовая доза интести-бактериофага при приеме внутрь:


  • детям до 6 месяцев — 10 мл

  • детям от 6 месяцев до 1 года — 10–15 мл

  • детям от 1 года до 3 лет — 15–20 мл

  • пациентам старше 3 лет — 20–30 мл

В клизме 1 раз в день:

  • детям до 6 месяцев — 10 мл

  • детям от 6 месяцев до 1 года — 20 мл

  • детям от 1 года до 3 лет — 30 мл

  • пациентам старше 3 лет — 40–60 мл

При избыточном росте протея, как следствии дисбактериоза, кроме бактериофагов, при медикаментозной терапии применяются различные пробиотки (Бифидумбактерин, Бифиформ, Лактобактерин, Ацилакт, Аципол и др. ) и/или адекватные конкретному штамму протея и причине дисбактериоза антибиотики (у взрослых).

На сайте www.gastroscan.ru в каталоге литературы имеется раздел «Дисбиоз», содержащий статьи, затрагивающие проблемы дисбактериозов органов ЖКТ.

Протей в анализе мочи Бактериурия — наличие бактерий в моче может является признаком воспаления в мочевыводящих путях, мочевом пузыре, почках. При отсутствии каких-либо симптомов, истинная бактериурия (инфекция мочевых путей) диагностируется при наличии не менее 105 микробных тел протеев (или других энтеробактерий) в 1 мл свежевыпущенной мочи, иначе предполагается, что загрязнение мочи происходит при ее заборе. Если бактериурия не сопровождается какими-либо симптомами, тогда она называется бессимптомной бактериурией. Бессимптомная бактериурия не всегда требует немедленного лечения.

При наличии симптомов или при заборе мочи катетером диагностический порог может быть значительно уменьшен. В частности, при наличии соответствующей клинической симптоматики (лихорадка, озноб, тошнота, рвота, боли в поясничной области, дизурия) и выделении не менее 10 лейкоцитов в 1 мкл мочи, критерием для диагностики острого пиелонефрита является наличие не менее 104 протеев (или других патогенных энтеробактерий) в 1 мл свежевыпущенной мочи.

Активность антибиотиков в отношении протеяАнтибиотики (из имеющих описание в данном справочнике), активные в отношении протея: рифаксимин, нифуроксазид. Антибактериальные средства (из имеющих описание в данном справочнике), активные в отношении proteus mirabilis: амоскициллин (за исключением индолположительных штаммов протея (proteus vulgaris) которые, наоборот, к амоксициллину устойчивы). Менее активен нифурател (только в отношении proteus mirabilis и proteus vulgaris). Большинство штаммов proteus mirabilis, в отличие от proteus vulgaris, чувствительны не только к ампициллину, но и к цефалоспоринам. Proteus mirabilis и proteus vulgaris чувствительны к левофлоксацину и ципрофлоксацину. Протеи устойчивы к тетрациклину.
Источник

Инфекции, вызванные протеем: фон, патофизиология, эпидемиология

Автор

Ширин А. Мазумдер, доктор медицинских наук, FIDSA  Ассоциированный профессор медицины, директор программы стипендий по инфекционным заболеваниям, отделение инфекционных заболеваний, отделение внутренней медицины, Медицинский колледж Центра медицинских наук Университета Теннесси, Врачи-методисты Университета Теннесси

Ширин Мазумдер, доктор медицинских наук, FIDSA является членом следующих медицинских обществ: Американская академия медицины ВИЧ, Американский колледж врачей, Американская медицинская ассоциация, Ассоциация медицины ВИЧ, Американское общество инфекционных заболеваний, Медицинское общество Мемфиса, Американское общество медицинской эпидемиологии. , Медицинская ассоциация Теннесси

Раскрытие информации: Нечего раскрывать.

Редакционная коллегия специалистов

Франсиско Талавера, PharmD, PhD Адъюнкт-профессор Фармацевтического колледжа Медицинского центра Университета Небраски; Главный редактор Medscape Drug Reference

Раскрытие информации: Получал зарплату от Medscape за трудоустройство. для: Медскейп.

Аарон Глатт, доктор медицины  Председатель медицинского факультета, заведующий отделением инфекционных заболеваний, больница-эпидемиолог, Общинная больница Южного Нассау

Аарон Глатт, доктор медицины, является членом следующих медицинских обществ: Американская ассоциация врачей-лидеров, Американский колледж врачей-пульмонологов, Американский колледж врачей, Американский колледж врачей-Американское общество внутренних болезней, Американская медицинская ассоциация, Американское общество микробиологии, Американское торакальное общество, Американская ассоциация венерических заболеваний, Американское общество инфекционных заболеваний, Международное общество по СПИДу, Общество Healthcare Epidemiology of America

Раскрытие информации: Нечего раскрывать.

Главный редактор

Майкл Стюарт Бронз, доктор медицинских наук  Дэвид Росс Бойд Профессор и заведующий кафедрой медицины Стюарта Дж. Вольфа, кафедра внутренних болезней, медицинский факультет Центра медицинских наук Университета Оклахомы; магистр Американского колледжа врачей; член Американского общества инфекционистов; Член Королевского колледжа врачей, Лондон,

Майкл Стюарт Бронз, доктор медицинских наук, является членом следующих медицинских обществ: Альфа-Омега-Альфа, Американский колледж врачей, Американская медицинская ассоциация, Ассоциация профессоров медицины, Американское общество инфекционистов, Медицинская ассоциация штата Оклахома, Южное общество клинических исследований

Раскрытие информации: Нечего раскрывать.

Дополнительные участники

Гас Гонсалес, доктор медицины  Онколог, медицинский центр Cox Branson and CoxHealth Springfield

Гас Гонсалес, доктор медицины, является членом следующих медицинских обществ: Американский колледж врачей – Американское общество внутренних болезней

Раскрытие информации: ничего не раскрывается.

Благодарности

Rhett L Jackson, MD Адъюнкт-профессор и заместитель председателя по образованию медицинского факультета, директор резидентуры по внутренним болезням Медицинского колледжа Университета Оклахомы; Помощник начальника медицинской службы, больница по делам ветеранов Оклахома-Сити

Ретт Л. Джексон, доктор медицинских наук, является членом следующих медицинских обществ: Американского колледжа врачей, Американского общества внутренних болезней и Американской медицинской ассоциации

.

Раскрытие информации: Нечего раскрывать.

Келли Струбл, DO Научный сотрудник кафедры инфекционных болезней Медицинского колледжа Университета Оклахомы

Kelley Struble, DO является членом следующих медицинских обществ: Американский колледж врачей и Американское общество инфекционистов

Пожар влияет на бактериальный состав соплодий Protea repens (Proteaceae) .2021 Октябрь 26;368(19):fnab132. дои: 10.1093/женщины/fnab132.

Принадлежности Расширять

Принадлежности

  • 1 Кафедра биохимии, генетики и микробиологии, Институт лесной и сельскохозяйственной биотехнологии, Университет Претории, Претория 0002, Южная Африка.
  • 2 Департамент природоохранной экологии и энтомологии, Стелленбосский университет, Стелленбос 7602, Южная Африка.

Элемент в буфере обмена

Зандер Р. Человек и соавт. FEMS Microbiol Lett. .

Показать детали Показать варианты

Показать варианты

Формат АннотацияPubMedPMID

. 2021 Октябрь 26;368(19):fnab132. дои: 10.1093/женщины/fnab132.

Принадлежности

  • 1 Кафедра биохимии, генетики и микробиологии, Институт лесной и сельскохозяйственной биотехнологии, Университет Претории, Претория 0002, Южная Африка.
  • 2 Департамент природоохранной экологии и энтомологии, Стелленбосский университет, Стелленбос 7602, Южная Африка.

Элемент в буфере обмена

Полнотекстовые ссылки Параметры отображения цитирования

Показать варианты

Формат АннотацияPubMedPMID

Абстрактный

Разнообразные бактериальные сообщества в растениях и вокруг них обеспечивают важные преимущества, такие как защита от патогенов и круговорот основных минералов за счет разложения умирающей биомассы растений.Биоразнообразные ландшафты финбос обычно имеют ограниченные места обитания валежника из-за отсутствия больших деревьев и частых пожаров. В этом исследовании мы определили влияние пожара на бактериальные сообщества в ландшафте финбос, в котором преобладает кустарник Protea repens, с помощью секвенирования ампликона рибосомной РНК 16S. Состав бактериального сообщества в новообразованных плодовых структурах (соплодиях) и почве на недавно выгоревшей площадке отличался от таковой на несгоревшей. Бактерии, населяющие P.repens были похожи на хорошо известные таксоны из разлагающейся древесины и подстилки. Это предполагает предполагаемую роль этих надземных растительных структур в качестве резервуаров для послепожарных разлагающих бактерий. Результаты показывают, что необычно частые пожары, которые являются обычным явлением в антропоцене, являются серьезным нарушением бактериальных сообществ и могут повлиять на разнообразие потенциально важных микробов в этих ландшафтах.

Ключевые слова: протея ползучая; Пожар; финбос; соплодия; связанные с растениями; повторно заселить.

© Автор(ы), 2021. Опубликовано Oxford University Press от имени FEMS.

Похожие статьи

  • Биоразнообразие и экология цветковых актиномицетов на разных стадиях цветения Protea repens.

    Human ZR, Crous CJ, Roets F, Venter SN, Wingfield MJ, de Beer ZW. ЗР человека и др.Антони Ван Левенгук. 2018 февраль; 111(2):209-226. doi: 10.1007/s10482-017-0942-3. Epub 2017 21 сентября. Антони Ван Левенгук. 2018. PMID: 28936706

  • Распространение на большие расстояния и повторное заселение ниши, разрушенной пожаром, грибком, ассоциированным с клещом.

    Эйлуорд Дж., Дрейер Л.Л., Стенкамп Э.Т., Вингфилд М.Дж., Роутс Ф. Эйлуорд Дж. и др. Грибковая биол. 2015 Апрель; 119 (4): 245-56. doi: 10.1016/j.funbio.2014.12.010. Epub 2015 3 января. Грибковая биол. 2015. PMID: 25813511

  • Состав сообщества почвенных бактерий спустя почти десять лет после пожара в тропическом лесу в Восточном Калимантане, Индонезия.

    Исобе К., Оцука С., Судиана И., Нурканто А., Сену К. Изобе К. и др. J Gen Appl Microbiol. 2009 г., октябрь; 55 (5): 329-37. doi: 10.2323/jgam.55.329. J Gen Appl Microbiol. 2009. PMID: 19940378

  • Синтез признаков послепожарного восстановления древесных растений в австралийских экосистемах.

    Кларк П.Дж., Лоус М.Дж., Мерфи Б.П., Рассел-Смит Дж., Нано К.Э., Брэдсток Р., Энрайт Н.Дж., Фонтейн Дж.Б., Госпер Ч.Р., Рэдфорд И., Мидгли Дж.Дж., Гантон Р.М. Кларк П.Дж. и др. Научная общая среда. 2015 15 ноября; 534: 31-42. дои: 10.1016/j.scitotenv.2015.04.002. Epub 2015 15 апр. Научная общая среда. 2015. PMID: 25887372

  • В растениях биома финбос обитают видоспецифичные бактериальные сообщества.

    Миямбо Т., Махаланяне Т.П., Коуэн Д.А., Вальверде А. Миямбо Т. и др. FEMS Microbiol Lett. 2016 авг;363(15):fnw122. дои: 10.1093/женщины/fnw122. Epub 2016 5 мая. FEMS Microbiol Lett.2016. PMID: 271

Типы публикаций

  • Поддержка исследований, за пределами США Правительство

термины MeSH

  • Протейные* / классификация
[Икс]

Укажите

Копировать

Формат: ААД АПА МДА НЛМ

Пожар влияет на бактериальный состав соплодий Protea repens (Proteaceae) | Письма FEMS по микробиологии

Получить помощь с доступом

Институциональный доступ

Доступ к контенту с ограниченным доступом в Oxford Academic часто предоставляется посредством институциональных подписок и покупок. Если вы являетесь членом учреждения с активной учетной записью, вы можете получить доступ к контенту следующими способами:

Доступ на основе IP

Как правило, доступ предоставляется через институциональную сеть к диапазону IP-адресов. Эта аутентификация происходит автоматически, и невозможно выйти из учетной записи с проверкой подлинности IP.

Войдите через свое учреждение

Выберите этот вариант, чтобы получить удаленный доступ за пределами вашего учреждения.

Технология Shibboleth/Open Athens используется для обеспечения единого входа между веб-сайтом вашего учебного заведения и Oxford Academic.

  1. Щелкните Войти через свое учреждение.
  2. Выберите свое учреждение из предоставленного списка, после чего вы перейдете на веб-сайт вашего учреждения для входа.
  3. При посещении сайта учреждения используйте учетные данные, предоставленные вашим учреждением. Не используйте личную учетную запись Oxford Academic.
  4. После успешного входа вы вернетесь в Oxford Academic.

Если вашего учреждения нет в списке или вы не можете войти на веб-сайт своего учреждения, обратитесь к своему библиотекарю или администратору.

Войти с помощью читательского билета

Введите номер своего читательского билета, чтобы войти в систему. Если вы не можете войти в систему, обратитесь к своему библиотекарю.

Члены общества

Многие общества предлагают своим членам доступ к своим журналам с помощью единого входа между веб-сайтом общества и Oxford Academic. Из журнала Oxford Academic:

  1. Щелкните Войти через сайт сообщества.
  2. При посещении сайта общества используйте учетные данные, предоставленные этим обществом. Не используйте личную учетную запись Oxford Academic.
  3. После успешного входа вы вернетесь в Oxford Academic.

Если у вас нет учетной записи сообщества или вы забыли свое имя пользователя или пароль, обратитесь в свое общество.

Некоторые общества используют личные аккаунты Oxford Academic для своих членов.

Личный кабинет

Личную учетную запись можно использовать для получения оповещений по электронной почте, сохранения результатов поиска, покупки контента и активации подписок.

Некоторые общества используют личные учетные записи Oxford Academic для предоставления доступа своим членам.

Институциональная администрация

Для библиотекарей и администраторов ваша личная учетная запись также предоставляет доступ к управлению институциональной учетной записью. Здесь вы найдете параметры для просмотра и активации подписок, управления институциональными настройками и параметрами доступа, доступа к статистике использования и т. д.

Просмотр ваших зарегистрированных учетных записей

Вы можете одновременно войти в свою личную учетную запись и учетную запись своего учреждения.Щелкните значок учетной записи в левом верхнем углу, чтобы просмотреть учетные записи, в которые вы вошли, и получить доступ к функциям управления учетной записью.

Выполнен вход, но нет доступа к содержимому

Oxford Academic предлагает широкий ассортимент продукции. Подписка учреждения может не распространяться на контент, к которому вы пытаетесь получить доступ. Если вы считаете, что у вас должен быть доступ к этому контенту, обратитесь к своему библиотекарю.

ГРИБЫ И БАКТЕРИИ, ПОРАЖАЮЩИЕ ПОСАДКИ PROTEA В ЧИЛИ

 
Авторы:   Р. Herrera, М. Обек, В. Вико, П. Ребульдо, М. Лол, Ф. Шиаппакас, C. Sandoval
Протеацеау, болезни, опрос
DOI: 10.17660/ActaHortic.2006.716.14
Резюме:
Протеи были введены в качестве новых коммерческих культур в течение последнего десятилетия в Чили. Площадь возделывания этих видов за последние годы увеличилась и находится между V и VII районами (приблизительно 33 градуса южной широты и 35 градусов южной широты).Однако насекомые и болезни, которые могли бы их поражать, снижая продуктивность и качество, для нашей страны не описаны. Чтобы получить более полное представление о природе ассоциированных микроорганизмов, образцы растений были взяты с симптомами, которые могут быть связаны с присутствием патогенов растений, с целью выявления патогенных грибов или бактерий. Из общего числа обнаруженных и идентифицированных возбудителей 86% составили грибы и 14% — бактерии. Среди грибов нами обнаружены роды Phytophthora sp., Fusarium sp., Alternaria sp., Cladosporium sp. и Botrytis sp., все они ранее были зарегистрированы в других странах как патогены, поражающие растения Proteaceae. В случае патогенных бактерий удалось выявить наличие Pseudomonas sp. и Xanthomonas sp. Первый был обнаружен в родах Protea, Leucadendron и Leucospermum , а другой — в чилийских аборигенных Proteaceae Gevuina avellana , а также в Protea.Ранее о Xanthomonas не сообщалось о поражении растений этого семейства. Учитывая, что Fusarium был одним из наиболее широко распространенных патогенов, в сезоне 2003/2004 гг. был проведен анализ для оценки Trichoderma harzianum в качестве альтернативы биологической профилактики. Различные концентрации этого грибка (суспензии конидий) применяли в качестве обработки перед инокуляцией Fusarium sp. Коммерческий фунгицид (беномил) использовали в качестве контроля, включая также две другие обработки без применения, одну инокулировали патогенным грибком, а другую инокулировали стерильной водой. Trichoderma снижал заболеваемость Fusarium увяданием, а две самые высокие протестированные концентрации (109 и 108 конидий/мл) статистически не отличались от беномила.

Загрузите Adobe Acrobat Reader (бесплатное программное обеспечение для чтения PDF-файлов)

Грибы и бактерии, поражающие насаждения протея в Чили

Протеи были введены в Чили в качестве новых коммерческих культур за последнее десятилетие.Площадь возделывания этих видов за последние годы увеличилась и находится между V и VII районами (примерно 33° южной широты и 35° южной широты). Однако насекомые и болезни, которые могли бы их поражать, снижая продуктивность и качество, для нашей страны не описаны. Чтобы получить более полное представление о природе ассоциированных микроорганизмов, образцы растений были взяты с симптомами, которые могут быть связаны с присутствием патогенов растений, с целью выявления патогенных грибов или бактерий.Из общего числа обнаруженных и идентифицированных возбудителей 86% составили грибы и 14% — бактерии. Среди грибов нами обнаружены роды Phytophthora sp., Fusarium sp., Alternaria sp., Cladosporium sp. и Botrytis sp., все они ранее были зарегистрированы в других странах как патогены, поражающие растения Proteaceae. В случае патогенных бактерий удалось выявить наличие Pseudomonas sp., Xanthomonas sp. Первый был обнаружен у родов Protea, Leucadendron и Leucospermum, а второй — у аборигенных чилийских Proteaceae Gevuina avellana, а также у Protea.Ранее о Xanthomonas не сообщалось о поражении растений этого семейства. Учитывая, что Fusarium является одним из наиболее широко распространенных патогенов, в сезоне 2003/2004 гг. было проведено исследование для оценки Trichoderma harzianum в качестве альтернативы биологической профилактики. Различные концентрации этого гриба (суспензии конидий) применяли в качестве обработки перед инокуляцией Fusarium sp. Коммерческий фунгицид (беномил) использовали в качестве контроля, включая также две другие обработки без применения, одну инокулировали патогенным грибком, а другую инокулировали стерильной водой.Триходерма снижала заболеваемость фузариозным увяданием, а две самые высокие испытанные концентрации (109 и 108 конидий/мл) статистически не отличались от беномила.

Бактериальная пятнистость листьев Protea cynaroides (King protea) . L’espèce Pseudomonas syringae, определяемый для 400 видов растений (le seul pathovar syringae a eté signalé sur 177 hôtes), имеет 3 важных свойства: un pouvoir pathogene, un pouvoir glaçogene и une aptitude à la vie épiphytasDans une première partie, les maines caractéristiques de l’espèce, hormis les caractères génétiques non significativement développés ici, sont présentées.

В отношении второй стороны, 3 свойства замечательных свойств анализируются в деталях. L’aptitude épiphyte Pseudomonas syringae s’exprime par une capacité à coloniser la surface des organes aériens des plantes, à s’y multiplier de façon Importante. Elle conduit à l’existence de niveaux de население élevés au printemps, et en automne aussi pour les plantes perennes; эти эпифитные популяции составляют резервуар инокулята и эфирные масла для инициации инфекции.Распределение популяций эпифитов, en général abondantes, n’est pas homogène ni entre plantes, ni entre organes d’une même plante; leur répartition à la surface de la feuille qui constitue leur support essentiel est aussi très hetérogène. La nature de l’interaction entre l’hôte et les bactéries épiphytes n’est pas connue; l’existence d’un laien Entre Sécificité parasitaire et la spécificité épiphyte au sein de l’espèce syringae estподозреваемый. Le pouvoir glaçogene de l’espèce syringae s’exprimant par une capacité à induire une précoce de la surfusion de l’eau ne концерн qu’une фракция де pathovars, essentiellement ле pathovar syringae. On a montré qu’il était impliqué dans la gélivité des plantes au printemps (винья, фруктовые деревья, помидоры, плод земной…) и qu’il est l’un des facteurs благоприятствует первым фазам бактериальной инфекции. Le pouvoir pathogene de Pseudomonas syringae montre une sécificité d’hôte Liée au pathovar consideré, sauf pour le pathovar syringae dont la gamme d’hôtes est actuellement Competitionée par plusieurs auteurs. Le développement de l’infection est Conditionné par l’existence de voies de ripétration naturelles (elles sont limitées) ou artificielles (blesses) offertes à l’inoculum; Подвесные климатические условия для начальных фаз инфекции и продолжительности инкубации с аппаратом, способным к модулю интенсивности инфекции.La connaissance де l’ансамбль де ces données permet une esquisse générale де цикл биологический à partir duquel де strategies де lutte peuvent être élaborées ; différents instances sont alors présentés en appui. Разнообразные перспективы исследований, посвященных особенностям бактериальных исследований. Pseudomonas syringae, эпифитная нуклеирующая активная и фитопатогенная бактерия. Pseudomonas syringae, один из 50 видов фитопатогенных бактерий, является наиболее часто встречающейся бактерией в условиях умеренного климата.P. syringae был выделен из = 400 различных растений-хозяев (177 хозяев для pv syringae) и характеризуется высокой генетической, физиологической и биологической изменчивостью, выраженной через 52 патовара. С этим видом связаны три важных свойства: патогенность, активность зародышеобразования льда и способность к эпифитному выживанию. Общая характеристика P syringae, кроме генетических аспектов, которые здесь не рассматривались, представлена ​​в первой части обзора. Во второй части были проанализированы 3 замечательных свойства вида.Для большинства патоваров характерна эпифитная выживаемость, выражающаяся в способности заселять надземные части растений или в значительном эпифитном размножении. Высокие уровни эпифитных популяций могут восстанавливаться весной, а также осенью для многолетних растений. Эти эпифитные популяции представляют собой источник инокулята и необходимы для развития инфекции. В целом обильное распространение эпифитных популяций неоднородно ни между растениями, ни внутри них; их распределение на поверхности листа, являющейся их основной опорой, также весьма неоднородно.Природа взаимодействия между эпифитными бактериями и их хозяином еще не известна, но была выдвинута гипотеза о связи между специфичностью хозяина в отношении патогенности и специфичностью хозяина в отношении эпифитной способности P. syringae. Ледяная нуклеационная активность P. syringae, выражающаяся в способности индуцировать раннюю нуклеацию воды, касается лишь некоторых патоваров, в основном патоваров syringae. Было показано, что он участвует в зарождении льдом растений и повреждениях от заморозков весной (например, виноградной лозы, помидоров, картофеля) и является одним из благоприятных факторов на первых стадиях некоторых бактериальных инфекций.Патогенность Pseudomonas syringae зависит от патовара, за исключением pv syringae, для которого характерен довольно широкий круг хозяев. Некоторые авторы оспаривают этот диапазон хозяев для последнего патовара. Развитие инфекции, вызванной Pseudomonas syringae, обусловлено наличием естественных (они ограничены) или искусственных (раны) путей проникновения в ткани растения и уровнем инокулята. Климатические условия на первых стадиях инфекции или в течение инкубационного периода, по-видимому, участвуют в модуляции интенсивности болезни.Эти биологические данные полезны для понимания жизненного цикла P. syringae и для разработки эффективной стратегии борьбы с болезнями; Затем для иллюстрации представлены различные примеры. Наконец, обсуждалось дальнейшее развитие исследований этой фитопатогенной бактерии.

Границы | Противогрибковые Streptomyces spp. Ассоциируется с соплодиями Protea spp. в Южной Африке

Введение

Виды рода Protea (Proteaceae) представляют собой кустарники и небольшие деревья, распространенные в странах Африки к югу от Сахары (Rourke, 1980).Всего известно 114 видов, из которых наибольшее разнообразие наблюдается в Капской флористической области (Rourke, 1980). Цветки Protea spp. собраны в соцветия (Rourke, 1980), и зрелые семена хранятся в этих структурах в течение длительного периода времени, прежде чем они высвобождаются, когда условия окружающей среды подходят для прорастания семян (Bond, 1985). Зрелые закрытые соцветия, содержащие семена, называются соплодиями. Соплодия многих видов остаются закрытыми до момента расселения и состоят из обильных отмерших тканей растений во влажной, теплой и часто колонизированной насекомыми среде.

Замечательная особенность закрытых соплодий Protea spp. заключается в том, что очень мало грибов колонизируют их в любой момент времени, несмотря на то, что они обеспечивают идеальные условия, в которых обычно процветают сапротрофные грибы (Marais and Wingfield, 1994; Zhou and Hyde, 2001; Roets et al., 2013). . Можно было бы ожидать обнаружить обычные сапрофиты, такие как виды Trichoderma, Penicillium и многие другие грибы, часто встречающиеся в сходных условиях в природе, но это не так. Ряд исследований показал, что до начала старения эта оболочка в основном занята специализированной группой аскомицетов, часто называемых офиостоматоидными грибами, принадлежащими либо к Ophiostomatales, либо к Microascales (Marais and Wingfield, 1994; Marais et al. , 1998; Wingfield et al., 1999; Roets et al., 2008, 2010, 2013). Офиостоматоидные ассоциаты соплодий Protea из Южной Африки в основном относятся к родам Sporothrix и Knoxdaviesia (= Gondwanamyces ) (Marais and Wingfield, 1994; Marais et al., 1998; Уингфилд и др., 1999; Roets и др., 2008, 2010, 2013; де Бир и др., 2013a,b, 2016).

Наша гипотеза, объясняющая отсутствие сапрофитов в соплодиях, заключается в том, что бактерии, продуцирующие антибиотики, могут подавлять их рост в этих условиях. Целью этого исследования было выяснить, встречаются ли бактерии, продуцирующие антибиотики, в соплодиях Protea repens и P. neriifolia . Также определяли противогрибковую активность таких изолятов в отношении обычных сапрофитов и обычно присутствующих ассоциатов офиостоматоидов.

Материалы и методы

Выделение бактериальных штаммов

P. repens соплодия (рис. 1) были собраны в заливе Прингл и в парке J.S. Ботанический сад Марэ недалеко от Стелленбоша и P . neriifolia соплодия из Прингл-Бей и Франсхук, Западно-Капская провинция, Южная Африка. Соплодия асептически вскрывали и удаляли части отдельных цветков, наружных прицветников обертки, внутренних прицветников обертки и цветоложа обертки.Образцы тканей из различных частей цветков суспендировали в растворе 6% дрожжевого экстракта и 0,05% SDS (додецилсульфата натрия) и инкубировали при 40°C в течение 20 мин (Hayakawa and Nonomura, 1989) с последующим разбавлением до 10 -6 для устранения противомикробного детергентного действия SDS (Hayakawa and Nonomura, 1989). Затем эти суспензии высевали на три типа искусственных сред: YEME, как описано Cafaro and Currie (2005), глицерин-аспарагиновый агар (Pridham and Lyons, 1961) и крахмал-казеиновый агар (Kuster and Williams, 1964).

Рисунок 1. A Protea repens ветвь с соплодиями .

Планшеты

инкубировали при 28°C в течение приблизительно 14 дней при постоянном наблюдении. Колонии, предварительно идентифицированные как актиномицеты на основании морфологии, были получены в чистой культуре повторным выделением на YEME (Cafaro and Currie, 2005). Затем изоляты были сгруппированы на основе схожей морфологии колоний. Из каждой группы были отобраны представители для дальнейшего изучения.Были приняты меры для включения изолятов от каждого вида хозяина и места отбора проб.

Экстракция ДНК и секвенирование

Геномную ДНК выделяли путем добавления мицелия из каждой отдельной чистой колонии в раствор Prepman Ultra™ (Applied Biosystems). Для идентификации изолятов для секвенирования был выбран участок гена 16S рибосомной РНК. Для дальнейшего филогенетического размещения изолятов были амплифицированы участки генов trpB, rpoB и gyrB . Участок гена 16S рРНК амплифицировали с использованием праймеров pA и pH, разработанных Edwards et al.(1989). Методы Guo et al. (2008) использовались для реакций ПЦР trpB и rpoB , а Rong et al. (2009) для гена gyrB . Все реакции проводили с использованием полимеразы SuperTherm taq (Southern Cross Biotechnology, Кейптаун, Южная Африка) на термоциклере Applied Biosystems Veriti Thermal Cyler. Ампликоны 16S рРНК (Edwards et al., 1989), gyrB (Rong et al., 2009), rpoB и trpB (Guo et al., 2008) секвенировали с использованием ранее описанных методов.Очищенные продукты ПЦР секвенировали с использованием системы ABI BigDye (Applied Biosystems) и очищали с использованием преципитации ацетатом натрия. Последовательности анализировали на анализаторе последовательностей ABI 3130 (Applied Biosystems).

Филогенетический анализ

Полученные изоляты первоначально идентифицировали путем сравнения их последовательностей 16S рРНК с последовательностями всех типов штаммов, доступными в базе данных RDP, с использованием программы Seqmatch, размещенной в рамках проекта Ribosomal Database Project II (RDP-II) (Maidak et al. , 2001).Наиболее близкие совпадающие последовательности достоверно описанных видов были загружены и включены в единый набор данных с нашими последовательностями. Mycobacterium tuberculosis использовали в качестве внешней группы.

Последовательности для 16S рРНК, gyrB, rpoB и trpB (дополнительная таблица S1) были объединены вместе с последовательностями из выбранных эталонных штаммов с использованием программного обеспечения SequenceMatrix (Vaidya et al., 2010). Концы последовательности обрезали с помощью Bioedit (Hall, 1999) и последовательности выравнивали с помощью MAFFT (Katoh et al., 2005). Наиболее подходящая модель нуклеотидной замены была определена с использованием JModeltest версии 0.1 (Posada, 2008) и выбрана с использованием информационных критериев Akaike (Posada and Buckley, 2004). Филогения максимального правдоподобия была получена с помощью PhyML версии 3.0 (Guindon et al., 2009) с использованием модели нуклеотидной замены TIM3 для 16S рРНК и модели нуклеотидной замены TVM+I+G для объединенного набора данных (Guindon et al. , 2009). ; Дарриба и др., 2012). Достоверность дерева измерялась с помощью бутстрап-поиска с 1000 повторами (Felsenstein, 1985).Дерево было визуализировано с помощью Mega 4 (Tamura et al., 2007).

In vitro Противогрибковые анализы Streptomyces spp. Штаммы из Протея Соплодия

Противогрибковые биоанализы проводились с использованием метода, описанного Cafaro and Currie (2005). Бактериальные изоляты, используемые в биоанализах, были выбраны случайным образом, по крайней мере, по два изолята из каждой группы (таблица 1). Отобранные грибковые изоляты были репрезентативными для грибов, встречающихся в соплодиях Protea spp.и вездесущие сапрофитные грибы. Knoxdaviesia proteae и Sporothrix splendens являются наиболее распространенными грибами в соплодиях P. repens и S . phasma встречается в P . neriifolia (Roets et al., 2009). Fusarium и Penicillium spp. являются вездесущими сапрофитными грибами, о которых иногда сообщалось из соплодий Protea spp. (Ли и др., 2005; Висаги и др.., 2014). Candida albicans чувствителен ко многим противогрибковым соединениям и является распространенным изолятом, используемым в противогрибковых анализах, которые могут служить контролем наблюдаемой противогрибковой активности. Все грибы были получены из коллекций культур CMW (Институт биотехнологии лесного хозяйства и сельского хозяйства, Университет Претории, Южная Африка; таблица 2), за исключением C. albicans (получен из ATCC) и Penicillium sp., который был изолирован от P . repens соплодие (данные не показаны).Были измерены чистые зоны между ростом грибов и предполагаемым бактериальным изолятом, продуцирующим антибиотик. Это называется зоной ингибирования и используется как показатель активности антибиотика и уровня чувствительности тестируемого организма (Cafaro and Currie, 2005).

Таблица 1. Изоляты Streptomyces , полученные в ходе настоящего исследования, их соответствующие источники и группировка на основе морфологии культуры и последовательностей генов 16S рРНК и потенциальных противогрибковых соединений .

Таблица 2. Зона ингибирования, зарегистрированная в парах биопроб .

Профилирование продукции вторичных метаболитов

Streptomyces spp.

Все штаммы Streptomyces культивировали в 200 мл среды YEME (4 г дрожжевого экстракта, 10 г солодового экстракта и 4 г глюкозы в 1 л дистиллированной воды) в колбах Эрленмейера на 500 мл. Профили вторичных метаболитов бактериальных штаммов анализировали с помощью ЖХ/МС каждые 2 дня. При мониторинге культур аликвоту 10 мл каждой культуры экстрагировали 10 мл этилацетата (EtOAc).Экстракты концентрировали 90–271 в вакууме 90–272 и ресуспендировали в 1 мл метанола (MeOH). После фильтрации экстрактов, растворимых в метаноле, 10 мкл каждого концентрированного экстракта в МеОН вводили в систему ЖХ/МС (ВЭЖХ серии Agilent 1200 в сочетании с масс-спектрометром Agilent 6130 single quad). Постоянно использовались условия градиента растворителя (0~20 мин: 10~100% CH 3 CN в H 2 O, 20~25 мин: 100% CH 3 CN/скорость потока: 0,7 мл/мин, 0,1 % муравьиной кислоты в CH 3 CN и H 2 O). УФ-детектор с диодной матрицей сканировал от 200 до 700 нм. Масс-спектрометрический анализ проводили как в режиме положительных, так и в режиме отрицательных ионов. Полученные профили ЖХ/МС анализировали с помощью программного обеспечения Agilent Chemstation 4.3.

Идентификация основных вторичных метаболитов из

Streptomyces spp. Штаммы

УФ-спектры основных распространенных вторичных метаболитов, обнаруженных при составлении химического профиля ЖХ-МС, сравнивали с собственной библиотекой УФ-спектров, связанной с Agilent Chemstation 4.3 софт. Для дальнейшего анализа основной вторичный метаболит Streptomyces группы 1 был получен путем крупномасштабного (18 л) культивирования репрезентативного штамма (PrRe2I22). Всю культуру экстрагировали 27 л этилацетата с получением 5 г сухого материала. Экстракт фракционировали на хроматографической колонке с обращенной фазой (C 18 ) (20, 40, 60, 80 и 100% MeOH в воде). Основной метаболит элюировался во фракциях 60 и 80% MeOH. Эти фракции подвергали дальнейшей очистке с помощью ВЭЖХ (Kromasil 100-5-C 18 250 × 10 мм, скорость потока 2 мл/мин, УФ-детектирование 360 нм, с 60% водным раствором метанола, 0.1% муравьиной кислоты) для выделения основного соединения. Основное соединение элюировалось через 35 мин с выходом 15 мг в виде желтой почвы. Структура основного метаболита штамма PrRe2I22 была идентифицирована с помощью спектроскопического анализа ЯМР, включая эксперименты 1 H, 13 C, COSY (корреляционная спектроскопия), HSQC (гетероядерная одиночная квантовая корреляция) и HMBC (гетероядерная множественная корреляция связей). а также сравнение литературы (Noguchi et al., 1988). Основной метаболит группы 2 сравнивали с метаболитом группы 1, поскольку их спектроскопические и хроматографические свойства были идентичными.Основное соединение, продуцируемое группой 3, было идентифицировано по данным УФ и МС, полученным с помощью анализа ЖХ/МС, и спектров 1 H и 13 C NNR.

In vitro Противогрибковый анализ фунгихромина Производится Streptomyces spp. Штаммы

Колонии штаммов грибов высевали в центр чашек Петри диаметром 90 мм, содержащих агар YEME, и инкубировали при 28°C. Через 4 дня на каждую чашку Петри с инокулированным агаром помещали четыре стерильных бумажных диска диаметром 6 мм.Стерильные бумажные диски пропитывали тремя концентрациями (10, 20, 50 мкл) фунгихромина (10 мг/мл), растворенного в ДМСО, а в качестве отрицательного контроля использовали 10 мкл ДМСО. За каждой чашкой Петри наблюдали в течение 28 дней.

Обнаружение фунгихромина непосредственно в образце соплодия

Образец соплодия был рассечен на обертку прицветников и соцветий. Затем каждую часть замачивали в МеОН и органические соединения экстрагировали МеОН в течение 3 часов. Экстракты MeOH анализировали с помощью ЖХ/МС с использованием следующих градиентных условий; 0~20 мин: 10~100% CH 3 CN в H 2 O, 20~25 мин: 100% CH 3 CN/расход: 0. 7 мл/мин, 0,1% муравьиной кислоты в CH 3 CN и H 2 O. УФ-детектор с диодной матрицей сканирует от 200 до 700 нм. Масс-спектрометрический анализ проводили как в режиме положительных, так и в режиме отрицательных ионов. Матричная лазерная десорбция/ионизация (MALDI) MS также была проведена в отношении чистого фунгихромина и образца соплодия. Для MALDI MS чистого фунгихромина 0,2 мг/мл фунгихромина в MeOH (0,5 мкл) сначала наносили и сушили на 384-луночном планшете MALDI-мишени (ASTA Inc., Сувон, Корея), а затем 0.5 мкл матричного раствора. Раствор матрицы представлял собой 10 мг/мл 2,5-дигидроксибензойной кислоты (ДГБ) в ацетонитриле/воде (50:50 об./об. ). Для прямого анализа образца соплодия рассеченные соцветия сначала прикрепляли к пластине-мишени MALDI с помощью проводящей двусторонней ленты и осторожно сушили в умеренном вакууме (~ 50 Торр). После сушки матричный раствор DHB распыляли на поверхность цветка с помощью аэрографа. Масс-спектры MALDI регистрировали в режиме положительного отражения с использованием анализатора ABI 4800 Plus MALDI-TOF/TOF (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA).

Результаты

Выделения бактериальных штаммов

Всего было получено 83 предполагаемых актиномицета. Все эти изоляты можно отнести к одной из трех морфологических групп. Изоляты, находящиеся в Streptomyces sp. Группа 1 имела мягкие черные колонии, продуцировала серые споры, а в окружающей питательной среде наблюдался желтый субстратный пигмент. Члены, принадлежащие к Streptomyces sp. Группа 2 образовывала желтые полупрозрачные колонии с серыми спорами.Все изоляты этой группы продуцировали красный субстратный пигмент. Streptomyces sp. Группа 3 имела белые колонии и продуцировала светло-серые споры, в то время как наблюдался красный пигмент субстрата. Из общего числа изолятов было отобрано 20, представляющих различные морфологические группы (таблица 1), для дальнейшей детальной идентификации.

Изоляты Streptomyces sp. Группа 1 была из P . repens в Прингл-Бей и Стелленбосе и P . neriifolia во Франшхуке. Streptomyces sp. Изоляты группы 2 были получены от обоих хозяев во всех местах отбора проб, в то время как Streptomyces sp. Изоляты группы 3 были получены из P . neriifolia в заливе Прингл и P . repens в Прингл-Бей и Стелленбосе (табл. 1).

Секвенирование ДНК и филогенетический анализ

Выровненный набор данных 16S рРНК, состоящий из последовательностей, полученных в настоящем исследовании, и последовательностей типовых штаммов из базы данных RDP, состоял примерно из 650 символов из видоспецифичной α-области последовательности гена 16S рРНК (Kataoka et al., 1997). Анализ максимального правдоподобия подтвердил, что изоляты, имеющие аналогичную морфологию, также сгруппированы вместе на основе последовательностей 16S рРНК (рис. 2). Кроме того, все изоляты, собранные в этом исследовании, сгруппированы среди видов Streptomyces .

Рисунок 2. ML-дерево, показывающее филогенетические отношения на основе последовательности гена 16S рРНК видов Streptomyces , полученных в ходе настоящего исследования . Номера изолятов из этого исследования выделены жирным шрифтом.Группы изолятов обозначены заштрихованными областями.

Согласно филогении максимальной вероятности 16S рРНК, изоляты, принадлежащие к Streptomyces sp. Группа 1 сформировала хорошо поддерживаемую, отчетливую кладу с типовыми штаммами S. griseofuscus, S. murinus, S. phaegriseochromogenes, S. costaricanus и неописанным Streptomyces sp. NRRL 30562 из змеиной лозы в Австралии (Castillo et al., 2002, 2006, рис. 2). Филогенетическое дерево ML, основанное на четырех объединенных генах, позволило разделить наши изоляты в этой группе на две клады; один, который включал изоляты из P.repens (PrRe2I4, PrRe2I22, PrRe3I4) с поддержкой бутстрепа 90%, в то время как PrNe0I20 из P. neriifolia сформировал сестринскую кладу и сгруппировался с типовым штаммом S. murinus с поддержкой бутстрапа 77% (рис. 3). Эти две клады сформировали более крупную группу, которая была отделена (93% поддержки начальной загрузки) от S. costaricanus, S. phaeogriseochromogenes и S. griseofuscus (рис. 3). Изоляты из этой группы могли принадлежать к S. murinus или предполагаемому виду S.padanus (Xiong et al., 2012).

Рисунок 3. Дерево максимального правдоподобия, показывающее филогенетическое размещение наших изолятов на основе конкатенации 16S рРНК- trpB rpoB gyrB Указаны только значения начальной загрузки выше 65%. Заштрихованные области обозначают группы изолятов.

На филогенетическом дереве 16S рРНК изоляты Streptomyces sp. Группа 2 образовала собственную кладу, не включающую последовательностей типовых штаммов (рис. 2).Наиболее близкими по типу были штаммы из S. misionensis, S. levis и S. phaeoluteichromogenes (рис. 2). В филогенетическом дереве MLSA эти изоляты также сгруппированы отдельно со значительным расстоянием до всех типовых штаммов и со 100% бутстрап-поддержкой и, таким образом, скорее всего, представляют собой неописанный вид. Интересно, что эта клада сформировала подгруппу, содержащую изоляты как из P. repens , так и из P. neriifolia .

Члены Streptomyces sp.Группа 3 сформировала отдельный кластер с 93% бутстрап-поддержкой с неидентифицированным штаммом (MG3) из почвы в Германии (Hoster et al., 2005). Согласно нашему MLSA, эти изоляты оставались в отдельном кластере со 100% поддержкой начальной загрузки и были отделены от типовых штаммов S. atratus и S. sanglieri (рис. 3).

In vitro Противогрибковые анализы

В анализы были включены семь бактериальных изолятов, которые представляли собой три разные группы, идентифицированные из соплодий Protea (таблица 2, рисунок 4).Изоляты, находящиеся в группе 1 Streptomyces , обычно обладали сильной ингибирующей активностью в отношении всех протестированных грибов и противогрибковой активностью в отношении Sporothrix spp. и K. proteae в целом выше, чем в отношении сапрофитных тест-грибов (табл. 2, рис. 4).

Рисунок 4. Тепловая карта, иллюстрирующая in vitro результаты биоанализа . Значения представлены от 0 до 22,8 по непрерывной шкале от желтого до красного. Филогенетические отношения между бактериальными изолятами представлены слева от тепловой карты.

Изоляты, принадлежащие к Streptomyces Группе 2, были способны ингибировать рост всех тестируемых грибов, хотя в целом это было ограничено и намного ниже, чем у членов Группы 1, и было зарегистрировано лишь ограниченное ингибирование двух тестовых сапрофитных грибов (Таблица 2). , рис. 4). Streptomyces sp. Группа 3 имела заметное ингибирование в отношении изолятов Penicillium и Fusarium , аналогичное ингибированию, наблюдаемому в группе 1. Интересно, что изоляты из этой группы имели более низкие уровни ингибирования в отношении Sporothrix spp.протестированных грибов, в то время как K. proteae в целом ингибировался до уровней, аналогичных Penicillium и Fusarium. Изоляты из группы 3 также имели гораздо более низкую ингибирующую активность в отношении C. albicans .

Идентификация основных вторичных метаболитов, продуцируемых

Streptomyces spp. Штаммы и противогрибковая активность

Для идентификации вторичных метаболитов Streptomyces spp. штаммы, ответственные за ингибирование роста грибов, мы культивировали Группы 1-3 Streptomyces spp.штаммов в жидкой культуральной среде. На основании химического профиля LC/MS (жидкостная хроматография и масс-спектрометрия) EtOAc-экстрактов культур отчетливо был обнаружен общий основной вторичный метаболит в штаммах групп 1 и 2. Это соединение имело типичную УФ-спектральную характеристику (λ макс. при 325, 340 и 362 нм), указывающую на существование пяти сопряженных двойных связей, и низкое разрешение молекулярного иона [M+Na] + при мкм / из 693.Сравнение УФ-спектра соединения с нашей собственной УФ-библиотекой, связанной с программным обеспечением ЖХ/МС, ясно показало, что этот метаболит был подобен пентамицину, который несет пентаеновую часть. Для точной идентификации структуры крупная культура (18 л) штамма Streptomyces sp. штамм (PrRe2I22). Впоследствии мы проанализировали 1 H (дополнительный рисунок S1), 13 C (дополнительный рисунок S2) и двумерные спектры ЯМР соединения, включая корреляцию 1 H- 1 H (COSY; дополнительный рисунок S3). ), гетероядерная одиночная квантовая когерентность (HSQC; дополнительный рисунок S4) и корреляция гетероядерных множественных связей (HMBC; дополнительный рисунок S5).Спектроскопический анализ и сопоставление спектроскопических данных с литературными (Noguchi et al., 1988) однозначно идентифицировали соединение 1-й и 2-й групп как фунгихромин, который также называют пентамицином, вторичным метаболитом полиенового поликетида, как мы и предполагали (рис. 5). ). Таким образом, основным вторичным метаболитом штаммов Streptomyces групп 1 и 2 является фунгихромин. Мы подтвердили, что фунгихромин отвечает за противогрибковую активность, наблюдаемую с помощью противогрибкового анализа (рис. 5).Чашки Петри наблюдали ежедневно в течение 28 дней (рис. 5). Фунгихромин ингибировал рост грибов дозозависимым образом (рис. 5).

Рис. 5. (A) Химическая структура фунгихромина. (B) Анализ противогрибковой активности в чашке Петри, показывающий размещение трех концентраций (10 мкл, 20 мкл, 50 мкл) фунгихромина (10 мг/мл), растворенного в ДМСО, контроля (только ДМСО, 10 мкл) и размещение грибкового инокулята. (C) Репрезентативные примеры изображений активности фунгихромина против Sporothrix africana CMW 1812, S.variecibatus CMW 23051, S. protea-sedis CMW 28601, Knoxdaviesia proteae CMW 3757, через 28 дней после инокуляции.

Также был обнаружен общий основной вторичный метаболит в штаммах группы 3. Это соединение показало отчетливую характеристику УФ-спектра (λ макс. при 220, 260 и 350 нм) и низкое разрешение молекулярных ионов [M+H] + при м / z 276. По сравнению с нашим домом Построенная УФ-библиотека, молекулярный ион, обнаруженный в МС, и спектрах ЯМР 1 H и 13 C (дополнительные рисунки S6, S7), этот метаболит был идентифицирован как актифенол (Highet and Prelog, 1959; Sun et al., 2014), который относится к классу циклогексимидов (рис. 6).

Рис. 6. (A) ЖХ/МС химический анализ жидкой культуры штамма Streptomyces PrRe3I6. УФ-хроматограмма при 280 нм (вверху) и масс-хроматограмма (внизу). (B) УФ- и масс-спектры основного вторичного метаболита актифенола. (C) Химическая структура актифенола.

Обнаружение фунгихромина в растительном материале

ЖХ/МС-анализ образцов соплодий, экстрагированных МеОН, четко выявил фунгихромин в оболочке прицветников и цветков.Точный ион [M+Na] + при m / z 693 наблюдали при том же времени удерживания, что и у чистого фунгихромина (рис. 7). Мы также попытались обнаружить фунгихромин непосредственно в образце соплодия с помощью MALDI MS. На рис. 8 представлены масс-спектры MALDI чистого фунгихромина и части цветка образца соплодия. Для чистого фунгихромина были четко обнаружены ионы аддукта натрия и калия фунгихромина ([M + Na] + и [M + K] + ) при m/z 693.50 и 709,48 соответственно (рис. 8А). В дополнение к этим ионам, другой интенсивный сигнал наблюдался при m/z 1363,50, и было обнаружено, что этот сигнал представляет собой аддуктивные ионы натрия димера фунгихромина ([2M + Na] + ) с помощью тандемной МС MALDI (МС/МС). . После подтверждения того, что фунгихромин легко обнаруживается с помощью MALDI MS, мы провели прямой анализ образца соплодия с помощью MALDI MS. На рис. 8В показан химический отпечаток пальца, полученный непосредственно от этого образца. В части цветка образца соплодия с помощью MALDI MS были обнаружены как ионы аддукта натрия фунгихромина, так и его димера.Хотя сигнал, соответствующий [M + Na] + при m/z 693,50, был вытеснен другими сигналами ионов метаболита, сигнал, соответствующий [2M + Na] + при m/z 1363,50, был отчетливо виден. (Рисунок 8В).

Рис. 7. (A) ЖХ-МС анализ экстракта образца соплодия Protea . УФ-хроматограмма (вверху) и масс-хроматограмма (внизу). (B) ЖХ/МС анализ чистого фунгихромина (УФ-обнаружение при 360 нм).

Рисунок 8. Масс-спектры MALDI в режиме положительных ионов (A) чистого фунгихромина и (B) образца соплодия (часть цветка) .

Обсуждение

Это исследование представляет собой первое открытие актиномицетов, продуцирующих антибиотики, в соплодиях Protea spp. Всего было идентифицировано три основные группы актиномицетов, и все они были видами Streptomyces . Биопробы показали, что некоторые из этих бактерий были антагонистами сапротрофных грибов, обнаруженных на внешней стороне соплодий Protea .Результаты этого исследования показывают, что присутствие актиномицетов, продуцирующих противогрибковые соединения, может способствовать отсутствию сапротрофных грибов в богатой питательными веществами, влажной и теплой среде, обнаруженной в соплодиях Protea (Roets et al. , 2012).

Изоляты из Streptomyces spp. Группа 1 имела идентичные последовательности 16S рРНК Streptomyces sp. NRRL 30562 (Castillo et al., 2002), эндофит из Kennedia nigriscans , идентифицированный как S.padanus , вид, который еще не был достоверно описан. Типовым штаммом, наиболее близким к нашим изолятам, был S. murinus (Frommer, 1959). Штаммы, идентифицированные как S. padanus , выделенные из почвы (Xiong et al., 2012), также были обнаружены у горного лавра ( Streptomyces sp. AOK-30) (Ericaceae) (Nishimura et al., 2002), которые могут повторно заражаться, чтобы стать более устойчивыми к грибковым патогенам (Nishimura et al., 2002). Streptomyces padanus обычно продуцирует антибиотик актиномицин (Kurosawa et al., 2006) и фунгихромин (Shih et al., 2003; Xiong et al., 2012). Фунгихромин также был идентифицирован как активное соединение, связанное с этой группой изолятов. Также было продемонстрировано образование этого соединения в естественных условиях, поскольку его можно было обнаружить в материале соплодия.

Наш MLSA показал, что Streptomyces sp. Группа 2 является неописанным видом и наиболее близка к типовым штаммам S. phaeoluteichromogenes, S. misionensis и S.Левис . Происхождение S. phaeoluteichromogenes и S. levis неизвестно, но S. misionensis первоначально был выделен из почвы в Аргентине. Штаммы, идентифицированные как S. misionensis , использовались в качестве агентов биологической борьбы с патогенами Fusarium Lilium spp. (Чунг и др., 2011). Streptomyces misionensis также был обнаружен на муравьях ( Allomerus spp.), и было обнаружено, что он противостоит грибковым патогенам в колониях муравьев (Seipke et al., 2012).

Streptomyces sp. Было показано, что группа 3 представляет собой неописанный вид, наиболее похожий на S. atratus и S. sanglieri , оба вида которых обнаружены в почве (Manfio et al., 2003). Streptomyces sanglieri продуцирует антибиотик лактонамицин Z, обладающий антибактериальной и противоопухолевой активностью (Zhang et al. , 2008). Streptomyces sp. MG3, наиболее подходящая последовательность из Genbank, была выделена из почвы в Германии и обладала сильной противогрибковой активностью благодаря продукции хитиназы (Hoster et al., 2005).

Все три группы изолятов были обнаружены на соплодиях P. repens и P. neriifolia , и ясно, что актиномицеты обычно присутствуют в соплодиях растений Protea . Наши результаты согласуются с другими исследованиями, в которых обнаружены бактерии, продуцирующие антибиотики Streptomyces spp. у растений, один из представителей семейства Proteaceae. Изоляты, находящиеся в Streptomyces sp. Группа 1 очень похожа на найденные в К.nigriscans в Австралии, которые продуцируют мунумбицин A, B, C и D, активный в отношении многих патогенных бактерий и грибков (Castillo et al., 2002, 2006). Grevillea pteridifolia , представитель Proteaceae из Австралии, является хозяином Streptomyces spp. которые производят ряд антибиотиков, известных как какадумицины (Castillo et al. , 2003). Монстера сп. содержит эндофитов Streptomyces , продуцирующих антибиотики коронамицина (Ezra et al., 2004).Считается, что все они обеспечивают некоторую защиту растения-хозяина (Strobel and Daisy, 2003).

Большинство видов, родственных изолятам, полученным в этом исследовании, происходят преимущественно из почвы, где Streptomyces spp. встречаются чаще всего (Kampfer, 2006). Члены семейства клещей Edbakerellidae обычно встречаются в почве, и несколько новых видов этого семейства были недавно обнаружены в соплодиях Protea (Theron et al., 2012). Streptomyces spp.имеют споры, которые хорошо приспособлены к расселению членистоногих (Ruddick and Williams, 1972; Chater, 2006). Кроме того, было показано, что споры S. griseus прикрепляются к экзоскелетам клещей, эффективно способствуя их распространению (Goodfellow and Williams, 1983), и разумно предположить, что эти клещи играют роль в поддержании Streptomyces spp. в протеи соплодия.

Streptomycetes способны переваривать некоторые сложные углеводы и азотсодержащие отходы, включая множество питательных веществ, недоступных для многих других организмов (Kaltenpoth, 2009).Они также используют хитин из остатков грибов или экзоскелетов насекомых, лигноцеллюлозу и некоторые другие растительные полимеры (Crawford, 1978; Kampfer, 2006). Из-за способности Streptomyces расти в самых разных средах и легкости, с которой они распространяются членистоногими (Ruddick and Williams, 1972; Goodfellow and Williams, 1983), они потенциально могут играть важную роль во взаимодействии между насекомыми. , клещи, грибки и Protea spp.

Все три группы Streptomyces spp.выделенные в этом исследовании, имели заметную противогрибковую активность. Представители Streptomyces spp. Группа 1 имела самую сильную противогрибковую активность в отношении всех протестированных грибов. Известно, что фунгихромин, полиеновое противогрибковое соединение, ингибирует широкий спектр грибков (Dixon and Walsh, 1996). Streptomyces spp. Группы 2, у которых основным вторичным метаболитом также является фунгихромин, обладали более сильной ингибирующей активностью в отношении офиостоматоидных грибов, чем в отношении неофиостоматоидных сапрофитов, возможно, из-за их более медленного роста и оптимального уровня продукции фунгихромина.Члены Streptomyces spp. Группа 3 производила актифенол, соединение, относящееся к классу противогрибковых циклогексимидов (Highet and Prelog, 1959). Эта группа обеспечила лучший рост Sporothrix spp. и C. albicans , которые, как известно, устойчивы к циклогексимиду (Yamada-Okabe и Yamada-Okabe, 2002; Roets et al., 2008). Из результатов биоанализа in vitro невозможно сделать вывод о возможной пользе для K. proteae , но ясно, что обычные сапротрофные грибы чувствительны к Streptomyces spp.из растений Protea .

Есть два потенциальных преимущества, предоставляемых растению актиномицетами. Соплодия Protea обеспечивают закрытую среду с идеальными условиями для роста грибков. Поэтому они подвергаются некоторому риску инвазии разлагающимися сапрофитами и патогенами. Кроме того, как только семена распространится и вступят в контакт с почвой, они вступят в контакт с более потенциально опасными микробами. Streptomyces spp.обладают способностью обеспечивать постоянную защиту, как это было показано на кукурузе, где уровни патогенных грибов в семенах были снижены за счет обработки смесью штаммов Streptomyces (Bressan, 2003). Так, Streptomyces spp. скорее всего, дают различные преимущества соплодиям Protea , и они должны были обеспечить положительную силу для поддержания отношений между ними.

Будущие исследования должны определить механизм инокуляции Streptomyces spp.в Protea spp., включая их способность распространяться и поедать членистоногими, населяющими соплодия Protea . Необходимо исследовать возможные мутуалистические взаимодействия, что может быть достигнуто за счет более широкой выборки по географическим регионам и во времени, и должно включать влияние большего количества переменных, таких как температура, осадки, тип почвы и связанное с ними разнообразие животных. Функциональная метагеномика — новая область исследований, которая также может быть применена к этой нише.Знание кластеров генов вторичных метаболитов грибов и бактерий, присутствующих в этой нише, может дать очень важные ответы для понимания сложных взаимодействий между Protea spp. и разнообразие микроорганизмов и животных, связанных с ними.

Вклад авторов

MW, ZdB, BS, ZH и SV концептуализировали исследование. ZH проводил выделения и анализы в лаборатории. ZH, ZdB и SV провели филогенетический анализ и анализ данных анализа. DO разработал химический анализ и интерпретировал химические данные.KM выполнил анализ ЖХ/МС и ЯМР и определил противогрибковые соединения. MB очищал и идентифицировал актифенол по данным ЯМР-спектроскопии. SC участвовал в масс-спектрометрическом анализе. ZH, SV, KM, DO, ZdB, SC, BS и MW написали и отредактировали текст. Ж и КМ внесли в эту работу одинаковый вклад.

Финансирование

Мы признательны за финансовую поддержку Департамента науки и технологий (DST) и Национального исследовательского фонда (NRF), Центра передового опыта в области биотехнологии здоровья деревьев (CTHB), Национального исследовательского фонда (NRF) и Университета Претории, Южная Африка. Эта работа также была поддержана грантом Национального исследовательского фонда Кореи, финансируемым правительством Кореи (Министерство ИКТ и планирования будущего; № 2014R1A2A1A11053477).

Заявление о конфликте интересов

Авторы заявляют, что исследование проводилось при отсутствии каких-либо коммерческих или финансовых отношений, которые могли бы быть истолкованы как потенциальный конфликт интересов.

Благодарности

Мы благодарим доктора Франсуа Руэ (Университет Стелленбоша) за помощь в полевых сборах.

Дополнительный материал

Дополнительный материал к этой статье можно найти в Интернете по адресу: https://www.frontiersin.org/article/10.3389/fmicb.2016.01657/full#supplementary-material

.

Каталожные номера

Бонд, WJ (1985). Запасы семян, хранящиеся в кроне (серотины) у мыса протейных. Южная Африка Дж. Бот. 51, 181–185. doi: 10.1016/S0254-6299(16)31669-6

Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

Брессан, В. (2003). Биологическая борьба с патогенными грибами семян кукурузы с помощью актиномицетов. Биоконтроль 48, 233–240. дои: 10.1023/A:1022673226324

Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

Кафаро, М.Дж., и Карри, Ч.Р. (2005). Филогенетический анализ мутуалистических нитчатых бактерий, связанных с муравьями, выращивающими грибы. Кан. Дж. Микробиол. 51, 441–446. doi: 10.1139/w05-023

Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

Кастильо, У. Ф., Стробел, Г. А., Форд, Э. Дж., Гесс, В. М., Портер, Х., Дженсен, Дж.Б. и др. (2002). Мунумицины, антибиотики широкого спектра действия, продуцируемые Streptomyces NRRL 30562, эндофитные на Kennedia nigriscans . Микробиология 148, 2675–2685. дои: 10.1099/00221287-148-9-2675

Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

Castillo, U.F., Strobel, G.A., Mullenberg, K., Condron, M.M., Teplow, D.B., Fogliano, V. , et al. (2006). Мунумбицины E-4 и E-5: новые антибиотики широкого спектра действия из Streptomyces NRRL 3052. FEMS микробиол. лат. 255, 296–300. doi: 10.1111/j.1574-6968.2005.00080.x

Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

Castillo, U., Harper, J.K., Strobel, G.A., Sears, J., Alesi, K., Ford, E., et al. (2003). Какадумицины, новые антибиотики из Streptomyces sp. NRRL 30566, эндофит Grevillea pteridifolia . FEMS микробиол. лат. 224, 183–190. doi: 10.1016/S0378-1097(03)00426-9

Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

Чейтер, К.Ф. (2006). Streptomyces наизнанку: новый взгляд на бактерии, которые обеспечивают нас антибиотиками. Филос. Транс. Р. Соц. В 361, 761–768. doi: 10.1098/rstb.2005.1758

Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

Chung, W.C., Wu, R.S., Hsu, C.P., Huang, H.C., and Huang, J. W. (2011). Применение антагонистических ризобактерий для борьбы с фузариозом и прикорневой гнилью лилии. Австралия. Завод Патол. 40, 269–276. doi: 10.1007/s13313-011-0040-3

Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

Кроуфорд, Д.Л. (1978). Разложение лигноцеллюлозы выбранными штаммами Streptomyces . Заяв. Окружающая среда. микробиол. 35, 1041–1045.

Реферат PubMed | Академия Google

де Бир, З. В., Дуонг, Т. А., и Вингфилд, М. Дж. (2016). Развод Sporothrix и Ophiostoma : решение проблемных отношений. Шпилька. Микол. 83, 165–191. doi: 10.1016/j.simyco.2016.07.001

Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

де Бир, З. В., Зайферт, К. А., и Вингфилд, М. Дж. (2013a). «Номенклатура офиостоматоидных родов и видов в офиостоматовых и микроаскалах», в The Ophiostomatoid Fungi: Expanding Frontiers , eds KA Seifert, ZW de Beer and MJ Wingfield (Utrecht: CBS), 245–322.

де Беер, З. В., Зайферт, К.А. и Вингфилд, М. Дж. (2013b). «Офиостоматоидные грибы: их двойное положение среди сордариомицетов», в Офиостоматоидные грибы: расширение границ , редакторы К. А. Зайферт, З. В. де Бир и М. Дж. Вингфилд (Утрехт: CBS), 1–19.

Диксон Д.М. и Уолш Т.Дж. (1996). «Противогрибковые агенты», в Глава 76: Медицинская микробиология, 4-е изд. , изд. С. Барон (Галвестон, Техас: Медицинское отделение Техасского университета в Галвестоне).

Эдвардс, У., Рогалл, Т., Blöcker, H., Ernde, M., and Böttger, E. (1989). Выделение и прямое полное определение нуклеотидов целых генов. Характеристика гена, кодирующего 16S рибосомную РНК. Рез. нуклеиновых кислот. 17, 7843–7853. дои: 10.1093/нар/17.19.7843

Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

Эзра, Д., Кастильо, У. Ф., и Стробель, Г. А. (2004). Коронамицины, пептидные антибиотики, продуцируемые вертициллятом Streptomyces sp. (МСУ-2110) эндофит на Monstera sp. Микробиология 150, 785–793. doi: 10.1099/мик.0.26645-0

Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

Фельзенштейн, Дж. (1985). Пределы достоверности филогений: подход с использованием бутстрапа. Эволюция 39, 783–791. дои: 10.2307/2408678

Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

Фроммер, В. (1959). Zur Systematik der Actinomycin bildenden Streptomyceten . Арх. микробиол. 32, 187–206. дои: 10.1007/BF00425228

Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

Гиндон, С., Delsuc, F., Dufayard, JF, и Gascuel, O. (2009). Оценка филогении максимального правдоподобия с PhyML. Методы Мол. биол. 537, 113–137. дои: 10.1007/978-1-59745-251-9_6

Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

Го, Ю., Чжэн, В., Жун, X., и Хуанг, Ю. (2008). Многолокусная филогения клады гена Streptomyces griseus 16S рРНК: использование анализа многолокусной последовательности для систематики стрептомицетов. Междунар. Дж. Сист. Эвол.микробиол. 58, 149–159. doi: 10.1099/ijs.0.65224-0

Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

Холл, Т.А. (1999). BioEdit: удобный редактор выравнивания биологических последовательностей и программа анализа для Windows 95/98/NT. Nucleic Acids Symp. сер. 41, 95–98.

Академия Google

Хаякава М. и Нономура Х. (1989). Новый метод интенсивной изоляции актиномицетов из почвы. Actinomycetologica 3, 95–104.doi: 10.3209/saj.3_95

Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

Highet, R.J., and Prelog, V. (1959). Stoffwechselprodukte von Actinomyceten. XVIII. Актифенол. Хелв. Чим. Acta 42, 1523–1526. doi: 10.1002/hlca.195514

Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

Хостер, Ф., Шмитц, Дж. Э., и Даниэль, Р. (2005). Обогащение хитинолитических микроорганизмов: выделение и характеристика хитиназы, проявляющей противогрибковую активность против фитопатогенных грибов, из нового штамма Streptomyces . Заяв. микробиол. Биотехнолог. 66, 434–442. doi: 10.1007/s00253-004-1664-9

Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

Кампфер, П. (2006). «Семейство Streptomycetaceae, Часть I: таксономия», в Прокариоты: Справочник по биологии бактерий , под редакцией М. Дворкина, С. Фалькова, Э. Розенберга, К.-Х. Шлейфер и Э. Штакебрандт (Берлин: Springer), 538–604.

Академия Google

Катаока М., Уэда К., Кудо Т., Секи Т.и Йошида, Т. (1997). Применение вариабельной области 16S рДНК для создания и индексирования для быстрой идентификации видов рода Streptomyces . FEMS микробиол. лат. 151, 249–255. doi: 10.1111/j.1574-6968.1997.tb12578.x

Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки

Като К., Кума К., Тох Х. и Мията Т. (2005). MAFFT версии 5: повышение точности множественного выравнивания последовательностей. Рез. нуклеиновых кислот. 33, 511–518. дои: 10.1093/нар/гки198

Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

Kurosawa, K. , Bui, V.P., VanEssendelft, J.L., Willis, L.B., Lessard, P.A., Ghiviriga, T., et al. (2006). Характеристика Streptomyces MITKK-103, недавно выделенного продуцента актиномицина X 2 . Заяв. микробиол. Биотехнолог. 72, 145–154. doi: 10.1007/s00253-005-0240-2

Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

Майдак, Б.L., Cole, J.R., Lilburn, T.G., Parker, C.T. Jr., Saxman, P.R., Farris, R.J., et al. (2001). RDP-II (проект рибосомной базы данных). Рез. нуклеиновых кислот. 29, 173–174. doi: 10.1093/нар/29.1.173

Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

Манфио, Г. П., Аталан, Э., Закшевска-Червинска, Дж., Мордарски, М., Родригес, К., Коллинз, М. Д., и соавт. (2003). Классификация новых почвенных стрептомицетов как Streptomyces aureus sp. nov., Streptomyces laceyi sp.ноябрь и Streptomyces sanglieri sp. ноябрь Антони ван Левенгук 83, 245–255. дои: 10.1023/A:1023332427794

Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

Марэ, Г.Дж., и Вингфилд, М.Дж. (1994). Грибы, связанные с соплодиями вида Protea в Южной Африке, включая новый вид Ophiostoma . Микол. Рез. 98, 369–374. doi: 10.1016/S0953-7562(09)81191-X

Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

Марэ, Г.J., Wingfield, M.J., Viljoen, C.D., and Wingfield, B.D. (1998). Новый род Ophiostomatoid из Protea соплодий. Микология 90, 136–141. дои: 10.2307/3761023

Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

Нисимура Т., Мегуро А., Хасегава С., Накагава Ю., Симидзу М. и Куно Х. (2002). Эндофитный актиномицет, Streptomyces sp. АОК-30, выделенный из горного лавра, и его противогрибковая активность. J. Gen. Plant Pathol. 68, 390–397. дои: 10.1007/PL00013109

Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

Ногучи Х. , Харрисон П. Х., Араи К., Накашима Т. Т., Тримбл Л. А. и Ведерас Дж. К. (1988). Биосинтез и полное определение ЯМР фунгихромина, полиенового антибиотика из целлюлозы Streptomyces . Дж. Ам. хим. соц. 110, 2938–2945. дои: 10.1021/ja00217a041

Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

Посада, Д., и Бакли, Т. Р. (2004).Выбор модели и усреднение модели в филогенетике: преимущества информационного критерия akaike и байесовского подхода перед тестами отношения правдоподобия. Сист. биол. 53, 793–808. дои: 10.1080/106351504304

Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

Придхэм, Т. Г., и Лайонс, А. Дж. (1961). Streptomyces albus (Rossi Doria) waksman et henrici: таксономическое исследование штаммов, помеченных как Streptomyces albus . J. Бактериол. 81, 431–441.

Реферат PubMed | Академия Google

Roets, F., de Beer, Z.W., Wingfield, M.J., Crous, P. W., and Dreyer, L.L. (2008). Ophiostoma gemellus и Sporothrix variecibatus из клещей, заражающих соплодия Protea в Южной Африке. Микология 100, 496–510. дои: 10.3852/07-181R

Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

Роутс Ф., Терон Н., Вингфилд М. Дж.и Дрейер Л.Л. (2012). Биотические и абиотические ограничения, которые способствуют исключительности хозяина Gondwanamyces и Ophiostoma на Protea . Грибковый биол. 116, 49–61. doi: 10.1016/j.funbio.2011.09.008

Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

Роутс, Ф., Вингфилд, Б.Д., де Бир, З.В., Вингфилд, М.Дж., и Дрейер, Л.Л. (2010). Два новых вида Ophiostoma из Protea caffra в Замбии. Персоония 24, 18–28. дои: 10.3767/003158510X4

Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

Roets, F., Wingfield, M.J., Crous, P. W., и Dreyer, L.L. (2009). Грибковая радиация в флористическом регионе мыса: анализ на основе Gondwanamyces и Ophiostoma . Мол. Филогенет. Эвол. 51, 111–119. doi: 10.1016/j.ympev.2008.05.041

Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

Роутс, Ф., Вингфилд, М.Дж., Краус, П.В., и Дрейер, Л.Л. (2013). «Таксономия и экология офиостоматоидных грибов, связанных с соплодиями Protea », в The Ophiostomatoid Fungi , eds KA Seifert, ZW de Beer и MJ Wingfield (Утрехт: CBS), 177–187.

Жун, X., Го, Ю., и Хуанг, Ю. (2009). Предложение реклассифицировать кладу Streptomyces albidoflavus на основе многолокусного анализа последовательности и гибридизации ДНК-ДНК, а также таксономического разъяснения Streptomyces griseus subsp.solvifaciens. Сист. заявл. микробиол. 32, 314–322. doi: 10.1016/j.syapm.2009.05.003

Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

Рурк, Дж. П. (1980). Протеи Южной Африки . Кейптаун: Пурнелл и сыновья.

Академия Google

Раддик С.М. и Уильямс С.Т. (1972). Исследования по экологии актиномицетов в почве V. Некоторые факторы, влияющие на распространение и адсорбцию спор в почве. Почвенный биол.Биохим. 4, 93–100. дои: 10.1016/0038-0717(72)

-6

Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

Seipke, R.F., Barke, J., Ruiz-Gonzalez, M.X., Orivel, J., Yu, D.W., and Hutchings, M.I. (2012). Выращивающие грибы муравьи Allomerus связаны с актинобактериями, продуцирующими антибиотики. Антони ван Левенгук 101, 443–447. doi: 10.1007/s10482-011-9621-y

Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

Ши, Х.Д., Лю, Ю. К., Хсу, Ф. Л., Мулабагал, В., Додда, Р., и Хуанг, Дж. В. (2003). Фунгихромин: вещество из Streptomyces padanus с ингибирующим действием на Rhizoctonia solani . Дж. Агрик. Пищевая хим. 51, 95–99. дои: 10.1021/jf025879b

Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

Сунь, Д., Сунь, В., Ю, Ю., Ли, З., Дэн, З. и Лин, С. (2014). Новое производное глутаримида из морских губок Streptomyces anulatus S71. Нац. Произв. Рез. 28, 1602–1606. дои: 10.1080/14786419.2014.928877

Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

Тамура, К., Дадли, Дж., Ней, М., и Кумар, С. (2007). MEGA4: программное обеспечение для молекулярно-эволюционного генетического анализа (MEGA), версия 4.0. Мол. биол. Эвол. 24, 1596–1599. doi: 10.1093/molbev/msm092

Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

Терон Н., Роутс Ф., Дрейер Л. Л., Эслер К. Дж.и Юкерманн, Э.А. (2012). Новый род и восемь новых видов tydeoidea (Acari: Trombidiformes) из вида Protea в Южной Африке. Междунар. Дж. Акарол. 38, 257–273. дои: 10.1080/01647954.2011.619576

Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

Вайдья Г. , Ломан Д. Дж. и Мейер Р. (2010). SequenceMatrix: программа конкатенации для быстрой сборки мультигенных наборов данных с набором символов и информацией о кодонах. Кладистика 27, 171–180.doi: 10.1111/j.1096-0031.2010.00329.x

Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

Visagie, C.M., Seifert, K.A., Houbraken, J., Samson, R.A., and Jacobs, K. (2014). Разнообразие Penicillium , секция Citrina в биоме финбос в Южной Африке, включая новый вид из соплодия Protea repens . Микология 106, 537–552. дои: 10.3852/13-256

Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

Вингфилд, Б.Д., Вилджоен, С.Д., и Вингфилд, М.Дж. (1999). Филогенетические взаимоотношения офиостоматоидных грибов, связанных с соплодиями Protea в Южной Африке. Микол. Рез. 103, 1616–1620. дои: 10.1017/S095375629

90

Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

Xiong, Z.Q., Zhang, Z. P., Li, J.H., Wei, S.J., and Tu, G.Q. (2012). Характеристика Streptomyces padanus JAU4234, продуцента актиномицина X2, фунгихромина и нового полиенового макролидного антибиотика. Заяв. Окружающая среда. микробиол. 78, 589–592. doi: 10.1128/AEM.06561-11

Полнотекстовая перекрестная ссылка | Академия Google

Ямада-Окабе, Т., и Ямада-Окабе, Х. (2002). Характеристика генов CaNAG3, CaNAG4 и CaNAG6 патогенного гриба Candida albicans : возможное участие этих генов в чувствительности к цитотоксическим агентам. FEMS микробиол. лат. 212, 15–21. doi: 10.1111/j.1574-6968.2002.tb11238.x

Реферат PubMed | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google

Чжан, X., Alemany, L.B., Fiedler, H.P., Goodfellow, M., and Parry, R.J. (2008). Биосинтетические исследования лактонамицина и лактонамицина Z: клонирование кластеров биосинтетических генов и открытие необычной стартовой единицы. Антимикроб. Агенты Чемотер. 52, 574–585.

Добавить комментарий

Ваш адрес email не будет опубликован.